More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1336 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1336  ISSfl3 OrfC  100 
 
 
205 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  73.89 
 
 
521 aa  314  5e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  47.45 
 
 
521 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  47.45 
 
 
522 aa  175  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  44.67 
 
 
504 aa  167  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  44.67 
 
 
504 aa  167  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  44.67 
 
 
504 aa  167  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  44.67 
 
 
528 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  44.1 
 
 
519 aa  165  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  44.1 
 
 
517 aa  165  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  44.1 
 
 
519 aa  165  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  44.62 
 
 
509 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  44.62 
 
 
509 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  44.62 
 
 
509 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  44.62 
 
 
509 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  44.62 
 
 
509 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  44.62 
 
 
509 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  42 
 
 
542 aa  157  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  42 
 
 
545 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  42.21 
 
 
527 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  42.21 
 
 
527 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  43.59 
 
 
511 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  43.59 
 
 
511 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  43.59 
 
 
511 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  43.59 
 
 
511 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  43.59 
 
 
511 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  43.59 
 
 
511 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  43.59 
 
 
511 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  42.05 
 
 
507 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  42.05 
 
 
506 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  42.05 
 
 
507 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  43.59 
 
 
511 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  43.08 
 
 
511 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  41.5 
 
 
545 aa  151  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  41.5 
 
 
545 aa  151  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  41.5 
 
 
545 aa  151  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  43.33 
 
 
538 aa  151  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  47.96 
 
 
505 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  47.96 
 
 
505 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  47.96 
 
 
505 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  42.86 
 
 
549 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  42.29 
 
 
530 aa  149  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  40.82 
 
 
545 aa  148  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  43.19 
 
 
549 aa  148  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  41.46 
 
 
579 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  41.79 
 
 
694 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  43.09 
 
 
530 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  41.46 
 
 
579 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  41.46 
 
 
579 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  41.46 
 
 
579 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  43.08 
 
 
517 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  42.06 
 
 
540 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  40.82 
 
 
545 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  44.75 
 
 
508 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  41.62 
 
 
540 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  41.62 
 
 
540 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  41.62 
 
 
540 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  40.82 
 
 
545 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  40.82 
 
 
545 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  40.82 
 
 
545 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  44.16 
 
 
523 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  40.82 
 
 
545 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  40.1 
 
 
532 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4540  transposase IS66  37.76 
 
 
337 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  42.86 
 
 
510 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  42 
 
 
491 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3593  transposase IS66  37.76 
 
 
404 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.324594  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  40.21 
 
 
531 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  40.1 
 
 
540 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  40.7 
 
 
556 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  38.39 
 
 
551 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  40.7 
 
 
530 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3984  transposase IS66  39.3 
 
 
311 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.637718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0929  transposase IS66  36.76 
 
 
516 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0524356  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0642  transposase IS66  36.76 
 
 
516 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153379  normal  0.0230063 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  37.24 
 
 
520 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  37.5 
 
 
537 aa  138  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  37 
 
 
537 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  39.3 
 
 
510 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  39.3 
 
 
510 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  37.24 
 
 
523 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  37.06 
 
 
523 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  37.24 
 
 
523 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  37.24 
 
 
523 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  37.24 
 
 
523 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  37.24 
 
 
523 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  40.74 
 
 
506 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  40.74 
 
 
506 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  40.74 
 
 
506 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  40.21 
 
 
510 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  40.21 
 
 
510 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  40.96 
 
 
517 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  40.96 
 
 
517 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  40.96 
 
 
517 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  40.96 
 
 
517 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  39.89 
 
 
503 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  40.96 
 
 
517 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  40.96 
 
 
517 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  40.96 
 
 
517 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  39.91 
 
 
562 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>