More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4540 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3593  transposase IS66  98.13 
 
 		 404 aa  638    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.324594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4540  transposase IS66  100 
 
 		 337 aa  686    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  55.13 
 
 		 508 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  53.14 
 
 		 491 aa  346  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  50.48 
 
 		 520 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  50.16 
 
 		 531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  49.68 
 
 		 523 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  49.68 
 
 		 523 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  49.68 
 
 		 523 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  49.68 
 
 		 523 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  49.68 
 
 		 523 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  49.68 
 
 		 523 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  50.48 
 
 		 532 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  49.36 
 
 		 523 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  47.62 
 
 		 516 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  51.89 
 
 		 535 aa  318  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  48.56 
 
 		 522 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  48.56 
 
 		 521 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  47.19 
 
 		 537 aa  308  8e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  51.42 
 
 		 556 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  47.27 
 
 		 522 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  46.88 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  46.88 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  46.88 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  46.88 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  46.88 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  46.88 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  46.88 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  46.88 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  47.19 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  47.19 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  46.56 
 
 		 512 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  47.8 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  47.19 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  47.19 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  46.56 
 
 		 512 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  47.19 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  47.19 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  47.19 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  47.19 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  47.19 
 
 		 512 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  48.23 
 
 		 512 aa  299  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  47.48 
 
 		 512 aa  298  9e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  47.48 
 
 		 512 aa  298  9e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  46.35 
 
 		 524 aa  297  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  44.09 
 
 		 533 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  46.35 
 
 		 523 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  46.35 
 
 		 523 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  46.35 
 
 		 523 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  46.35 
 
 		 523 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  46.35 
 
 		 523 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  46.35 
 
 		 523 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  47.48 
 
 		 527 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  47.48 
 
 		 527 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  44.3 
 
 		 537 aa  295  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  45.54 
 
 		 524 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  46.37 
 
 		 510 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  48.43 
 
 		 505 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  43.99 
 
 		 537 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  48.43 
 
 		 505 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  48.43 
 
 		 505 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0805  putative transposase IS66  44.37 
 
 		 378 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  43.08 
 
 		 531 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  45.9 
 
 		 537 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3899  IS66 family element, transposase  42.41 
 
 		 530 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0255  IS66 family element, transposase  42.41 
 
 		 530 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0847  IS66 family element, transposase  42.41 
 
 		 530 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1284  IS66 family element, transposase  42.41 
 
 		 530 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2961  IS66 family element, transposase  42.41 
 
 		 530 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.834706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>