22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6190 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6190    100 
 
 		 827 bp  1639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  80.42 
 
 		 1659 bp  194  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  80.42 
 
 		 1659 bp  194  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9094    80.42 
 
 		 1660 bp  194  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  80.42 
 
 		 1659 bp  194  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1584  hypothetical protein  84.69 
 
 		 1086 bp  143  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  84.62 
 
 		 1662 bp  99.6  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4608  transposase IS66  83.85 
 
 		 1065 bp  91.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0241583  normal  0.199267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  88.31 
 
 		 1623 bp  81.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  82.14 
 
 		 1656 bp  79.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4904    82.14 
 
 		 2921 bp  79.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  86.36 
 
 		 1617 bp  79.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  81.63 
 
 		 1602 bp  77.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  85.56 
 
 		 1650 bp  75.8  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  87.01 
 
 		 1650 bp  73.8  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  82.26 
 
 		 1614 bp  71.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  82.26 
 
 		 1575 bp  71.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5078  transposase IS66  81.02 
 
 		 840 bp  65.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  94.59 
 
 		 1608 bp  58  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  89.13 
 
 		 1671 bp  52  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3195    90 
 
 		 1697 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  93.75 
 
 		 1689 bp  48.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>