42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0744 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0744    100 
 
 		 702 bp  1392    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0745    100 
 
 		 540 bp  246  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1438    87.56 
 
 		 669 bp  192  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  87.38 
 
 		 1530 bp  101  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  87.38 
 
 		 1530 bp  101  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  87.38 
 
 		 1530 bp  101  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1167    87.38 
 
 		 3476 bp  101  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366883  normal  0.484716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  87.38 
 
 		 1530 bp  101  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  87.38 
 
 		 1530 bp  101  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  87.38 
 
 		 1530 bp  101  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  81.44 
 
 		 1536 bp  99.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  81.44 
 
 		 1536 bp  99.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  83.33 
 
 		 1623 bp  99.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  83.33 
 
 		 1623 bp  99.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  83.33 
 
 		 1623 bp  99.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  81.03 
 
 		 1536 bp  93.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  83.46 
 
 		 1536 bp  89.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  83.46 
 
 		 1536 bp  89.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  83.46 
 
 		 1536 bp  89.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  84.82 
 
 		 1536 bp  87.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  82.93 
 
 		 1536 bp  77.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  82.93 
 
 		 1536 bp  77.8  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  87.67 
 
 		 1560 bp  73.8  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  87.67 
 
 		 1560 bp  73.8  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  87.67 
 
 		 1554 bp  73.8  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3355    83.19 
 
 		 467 bp  73.8  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  84.17 
 
 		 1554 bp  71.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51550  putative transposase  80.12 
 
 		 1101 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000328821  hitchhiker  0.0000539108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  78.73 
 
 		 1524 bp  65.9  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  78.73 
 
 		 1524 bp  65.9  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3042    81.34 
 
 		 489 bp  60  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0204685  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  85.51 
 
 		 1521 bp  58  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1594    96.88 
 
 		 1329 bp  56  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0632    81.51 
 
 		 469 bp  54  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0422  transposase IS66  85.07 
 
 		 825 bp  54  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0710  transposase IS66  83.13 
 
 		 729 bp  54  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5957    84.51 
 
 		 1182 bp  54  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0111305 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2257    85.96 
 
 		 1678 bp  50.1  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3195    96.43 
 
 		 1697 bp  48.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  85.71 
 
 		 1515 bp  48.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  85.71 
 
 		 1515 bp  48.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  85.71 
 
 		 1515 bp  48.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>