39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0632 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0632    100 
 
 		 469 bp  930    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  82.42 
 
 		 1554 bp  89.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  90.48 
 
 		 1530 bp  77.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0422  transposase IS66  80.63 
 
 		 825 bp  77.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1167    90.48 
 
 		 3476 bp  77.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366883  normal  0.484716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  90.48 
 
 		 1530 bp  77.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  90.48 
 
 		 1530 bp  77.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  90.48 
 
 		 1530 bp  77.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  90.48 
 
 		 1530 bp  77.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  90.48 
 
 		 1530 bp  77.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5957    89.23 
 
 		 1182 bp  73.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0111305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  86.96 
 
 		 1560 bp  65.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1190  transposase IS66  86.96 
 
 		 1308 bp  65.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.808109  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  86.96 
 
 		 1560 bp  65.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  86.96 
 
 		 1554 bp  65.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  93.18 
 
 		 1536 bp  63.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  93.18 
 
 		 1536 bp  63.9  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  93.18 
 
 		 1536 bp  63.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  90.91 
 
 		 1536 bp  56  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  90.91 
 
 		 1536 bp  56  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  90.91 
 
 		 1536 bp  56  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  90.91 
 
 		 1536 bp  56  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  90.91 
 
 		 1536 bp  56  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0744    81.51 
 
 		 702 bp  54  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0710  transposase IS66  84.62 
 
 		 729 bp  50.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  85.25 
 
 		 1572 bp  50.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  91.89 
 
 		 1536 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0745    84.62 
 
 		 540 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  93.75 
 
 		 1515 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3042    91.67 
 
 		 489 bp  48.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0204685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3355    88.64 
 
 		 467 bp  48.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  79.27 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  100 
 
 		 1002 bp  48.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  93.75 
 
 		 1515 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  93.75 
 
 		 1515 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  100 
 
 		 1623 bp  46.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  100 
 
 		 1623 bp  46.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  100 
 
 		 1623 bp  46.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3066  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  100 
 
 		 891 bp  46.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.693032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>