32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3355 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3355    100 
 
 		 467 bp  926    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  88.24 
 
 		 1536 bp  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  87.96 
 
 		 1536 bp  367  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  87.68 
 
 		 1536 bp  359  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  87.68 
 
 		 1536 bp  359  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  87.11 
 
 		 1536 bp  343  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  87.11 
 
 		 1536 bp  343  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  87.11 
 
 		 1536 bp  343  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  85.43 
 
 		 1536 bp  295  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0650  hypothetical protein  88.07 
 
 		 111 bp  113  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  80.43 
 
 		 1536 bp  101  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0744    83.19 
 
 		 702 bp  73.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4650    88.71 
 
 		 681 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4016  ISPpu14, transposase Orf3  92 
 
 		 369 bp  67.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0745    87.5 
 
 		 540 bp  63.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1224    88.24 
 
 		 299 bp  54  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.65884  hitchhiker  0.00000296616 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5957    92.31 
 
 		 1182 bp  54  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0111305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51550  putative transposase  100 
 
 		 1101 bp  52  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000328821  hitchhiker  0.0000539108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1438    82.22 
 
 		 669 bp  52  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3042    77.88 
 
 		 489 bp  52  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0204685  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1167    93.94 
 
 		 3476 bp  50.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366883  normal  0.484716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  93.94 
 
 		 1530 bp  50.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  93.94 
 
 		 1530 bp  50.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  93.94 
 
 		 1530 bp  50.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  93.94 
 
 		 1530 bp  50.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  93.94 
 
 		 1530 bp  50.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  93.94 
 
 		 1530 bp  50.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0632    88.64 
 
 		 469 bp  48.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  83.1 
 
 		 1524 bp  46.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  83.1 
 
 		 1521 bp  46.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  83.1 
 
 		 1524 bp  46.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  91.43 
 
 		 1554 bp  46.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>