60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1167 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 372 bp  737    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1167    100 
 
 		 3476 bp  6891    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366883  normal  0.484716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 372 bp  737    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1169  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 336 bp  666    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.730957  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  100 
 
 		 1530 bp  3033    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  100 
 
 		 1530 bp  3033    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  100 
 
 		 1530 bp  3033    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  100 
 
 		 1530 bp  3033    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 372 bp  737    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 372 bp  737    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  100 
 
 		 1530 bp  3033    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  100 
 
 		 1530 bp  3033    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0834  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.323276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3323  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.981271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1486  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2668  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.89024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2976  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 291 bp  577  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3324  hypothetical protein  100 
 
 		 288 bp  571  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1487  hypothetical protein  100 
 
 		 288 bp  571  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221833 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5957    82.72 
 
 		 1182 bp  468  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0111305 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  80.21 
 
 		 378 bp  157  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  79.93 
 
 		 1554 bp  107  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  80.66 
 
 		 1554 bp  105  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  80.66 
 
 		 1560 bp  105  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1190  transposase IS66  80.66 
 
 		 1308 bp  105  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.808109  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  80.66 
 
 		 1560 bp  105  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5956    85.6 
 
 		 147 bp  105  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0744    87.38 
 
 		 702 bp  101  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6938  IS66 Orf2 family protein  80.85 
 
 		 339 bp  87.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1438    85 
 
 		 669 bp  79.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  84.62 
 
 		 1536 bp  79.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0632    90.48 
 
 		 469 bp  77.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  78.36 
 
 		 1623 bp  71.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  78.36 
 
 		 1623 bp  71.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  78.36 
 
 		 1623 bp  71.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  80.92 
 
 		 1536 bp  71.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  100 
 
 		 1515 bp  67.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  90.74 
 
 		 1563 bp  67.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  100 
 
 		 1515 bp  67.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  100 
 
 		 1515 bp  67.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51550  putative transposase  83.17 
 
 		 1101 bp  65.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000328821  hitchhiker  0.0000539108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  93.33 
 
 		 1536 bp  65.9  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  93.33 
 
 		 1536 bp  65.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  93.18 
 
 		 1536 bp  63.9  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  93.18 
 
 		 1536 bp  63.9  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6598  transposase IS66 family  84.81 
 
 		 147 bp  61.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2504  RNA polymerase factor sigma-70  84.81 
 
 		 1056 bp  61.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1594    80.43 
 
 		 1329 bp  60  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0423  IS66 Orf2 family protein  90 
 
 		 288 bp  60  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  92.68 
 
 		 1536 bp  58  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  92.68 
 
 		 1536 bp  58  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  92.68 
 
 		 1536 bp  58  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3042    79.5 
 
 		 489 bp  58  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0204685  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  85.29 
 
 		 1572 bp  56  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0710  transposase IS66  84.85 
 
 		 729 bp  52  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0746  IS66 Orf2 like  96.55 
 
 		 366 bp  50.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0422  transposase IS66  84.62 
 
 		 825 bp  50.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5983  IS66 Orf2 family protein  90.24 
 
 		 333 bp  50.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3355    93.94 
 
 		 467 bp  50.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  88.89 
 
 		 1101 bp  50.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>