295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0834 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0834  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.323276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2668  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.89024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2976  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3323  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.981271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1486  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1169  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 111 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.730957  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0571  IS66 Orf2 family protein  66.67 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.915168  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2456  IS66 Orf2 family protein  66.67 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.718541  normal  0.912363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2917  IS66 Orf2 family protein  66.67 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.722189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0746  IS66 Orf2 like  64.58 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1191  IS66 Orf2 family protein  65.62 
 
 		 110 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2522  IS66 Orf2 family protein  65.62 
 
 		 110 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1021  IS66 Orf2 family protein  65.62 
 
 		 110 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1402  IS66 Orf2 family protein  65.62 
 
 		 110 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6938  IS66 Orf2 family protein  63.92 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5983  IS66 Orf2 family protein  61.46 
 
 		 110 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2710  IS66 Orf2 like  64.58 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3793  putative transposase  63.92 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5174  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 		 111 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417  IS66 family transposase  63.92 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221323  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1866  transposase, Orf2 like  63.92 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733675  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0711  IS66 Orf2 family protein  64.58 
 
 		 110 aa  120  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1172  IS66 Orf2 like  62.5 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.768897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3060  IS66 Orf2 like  62.5 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59570  putative transposase  60.42 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207074  hitchhiker  4.45404e-19 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0038  IS66 Orf2 family protein  59.38 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.244042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3500  ISPpu14, transposase Orf2  59.38 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3965  ISPpu14, transposase Orf2  59.38 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3980  ISPpu14, transposase Orf2  59.38 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4438  ISPpu14, transposase Orf2  59.38 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000480323 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4022  IS66 Orf2 family protein  58.33 
 
 		 111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0423  IS66 Orf2 family protein  64.21 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4442  ISPpu14, transposase Orf2  65.48 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5397  ISPpu14, transposase Orf2  65.48 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  hitchhiker  0.00237418 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4448  IS66 Orf2 family protein  57.14 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.657267  normal  0.0820923 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4708  IS66 Orf2 family protein  55.21 
 
 		 98 aa  106  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123105  normal  0.103462 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4706  IS66 Orf2 family protein  55.21 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343016  normal  0.106133 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1058  IS66 Orf2 family protein  41.05 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.66521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1089  IS66 Orf2 family protein  41.05 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1365  IS66 Orf2 family protein  41.05 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1481  IS66 Orf2 family protein  41.05 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160906 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  40.62 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  40.62 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  42.7 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  42.7 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  42.7 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  42.7 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  42.7 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1087  IS66 Orf2 like protein  42.65 
 
 		 221 aa  60.1  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2256  IS66 Orf2 family protein  36.26 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.286379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  36.56 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2522  IS66 Orf2 family protein  40 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  36.78 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  36.78 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  36.78 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4533  IS66 Orf2 family protein  42.86 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  38.03 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3091  IS66 Orf2 family protein  40.68 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1411  IS66 Orf2 family protein  40.68 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3408  IS66 family transposase  32.18 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  32.18 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  32.18 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  32.18 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  39.33 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0079  hypothetical protein  39.06 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2549  putative IS66 transposase, TnpB  39.06 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3737  putative transposase  39.06 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6442  IS66 Orf2 family protein  37.04 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000390412 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  33.33 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3197  IS66 Orf2 family protein  30.68 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3699  hypothetical protein  29.55 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.603868 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4398  IS66 Orf2 family protein  29.55 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  31.03 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  33.33 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  33.33 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  33.33 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  33.33 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  33.33 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  34.48 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  34.09 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  40 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3595  IS66 Orf2 family protein  34.92 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  36.78 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  32.56 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2338  IS66 Orf2 like  33.9 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  33.33 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  35.63 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  33.33 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7465  IS66 Orf2 family protein  38.98 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6578  IS66 Orf2 family protein  32.91 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4745  IS66 Orf2 family protein  37.93 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6338  IS66 Orf2 like  37.29 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  32.18 
 
 		 115 aa  47.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4918  IS66 Orf2 family protein  38.6 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4275  ISSfl4 ORF2  32.56 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.935918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1583  hypothetical protein  31.96 
 
 		 115 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0639  IS66 Orf2 family protein  36.21 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  34.85 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6839  IS66 Orf2 family protein  35.59 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  32.18 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>