More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1169 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1169  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 111 aa  227  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.730957  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0834  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 96 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.323276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2668  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 96 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.89024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1486  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 96 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3323  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 96 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.981271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2976  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 96 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0746  IS66 Orf2 like  65.77 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2522  IS66 Orf2 family protein  67.57 
 
 		 110 aa  153  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1191  IS66 Orf2 family protein  67.57 
 
 		 110 aa  153  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1021  IS66 Orf2 family protein  67.57 
 
 		 110 aa  153  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1402  IS66 Orf2 family protein  67.57 
 
 		 110 aa  153  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5983  IS66 Orf2 family protein  65.77 
 
 		 110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6938  IS66 Orf2 family protein  66.96 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417  IS66 family transposase  66.07 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221323  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1866  transposase, Orf2 like  66.07 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733675  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5174  IS66 Orf2 family protein  64.86 
 
 		 111 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0711  IS66 Orf2 family protein  67.57 
 
 		 110 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0038  IS66 Orf2 family protein  62.16 
 
 		 111 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.244042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59570  putative transposase  63.06 
 
 		 111 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207074  hitchhiker  4.45404e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3500  ISPpu14, transposase Orf2  62.16 
 
 		 111 aa  146  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3965  ISPpu14, transposase Orf2  62.16 
 
 		 111 aa  146  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3980  ISPpu14, transposase Orf2  62.16 
 
 		 111 aa  146  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4438  ISPpu14, transposase Orf2  62.16 
 
 		 111 aa  146  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000480323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3793  putative transposase  65.18 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1172  IS66 Orf2 like  63.96 
 
 		 111 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.768897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3060  IS66 Orf2 like  63.96 
 
 		 111 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4022  IS66 Orf2 family protein  61.26 
 
 		 111 aa  143  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4442  ISPpu14, transposase Orf2  67.68 
 
 		 111 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5397  ISPpu14, transposase Orf2  67.68 
 
 		 111 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  hitchhiker  0.00237418 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2710  IS66 Orf2 like  63.96 
 
 		 111 aa  142  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2917  IS66 Orf2 family protein  65.05 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.722189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2456  IS66 Orf2 family protein  65.05 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.718541  normal  0.912363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0571  IS66 Orf2 family protein  65.05 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.915168  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4448  IS66 Orf2 family protein  58.41 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.657267  normal  0.0820923 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4706  IS66 Orf2 family protein  56.76 
 
 		 113 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343016  normal  0.106133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0423  IS66 Orf2 family protein  64.21 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4708  IS66 Orf2 family protein  55.21 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123105  normal  0.103462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1481  IS66 Orf2 family protein  41.82 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1089  IS66 Orf2 family protein  41.82 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1058  IS66 Orf2 family protein  41.82 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.66521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1365  IS66 Orf2 family protein  41.82 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579421 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  42.86 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  42.86 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  44.9 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  44.9 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  44.9 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  44.9 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  44.9 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2256  IS66 Orf2 family protein  38.1 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.286379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1087  IS66 Orf2 like protein  34.58 
 
 		 221 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  34.29 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  34.29 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  34.29 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  35.29 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0079  hypothetical protein  34.86 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2549  putative IS66 transposase, TnpB  34.86 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3737  putative transposase  34.86 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  34.91 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  39.8 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7465  IS66 Orf2 family protein  35.92 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  32.29 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3408  IS66 family transposase  32.29 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  32.29 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  32.29 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  34.38 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6442  IS66 Orf2 family protein  37.78 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000390412 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  34.02 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  35.42 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4745  IS66 Orf2 family protein  35.11 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  36.46 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4398  IS66 Orf2 family protein  29.9 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201394  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3197  IS66 Orf2 family protein  30.93 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3699  hypothetical protein  29.9 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.603868 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  35.42 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  34.74 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  34.38 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  34.38 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  34.38 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  34.38 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  34.38 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2522  IS66 Orf2 family protein  33.33 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  36.17 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  34.38 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3091  IS66 Orf2 family protein  34.31 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1411  IS66 Orf2 family protein  34.31 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  32.99 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1728  transposase  35.19 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  33.33 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1583  hypothetical protein  33.02 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0398  IS66 Orf2 like  31.63 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  32.71 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0258  hypothetical protein  30.84 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0620314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2338  IS66 Orf2 like  30.93 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  34.38 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4918  IS66 Orf2 family protein  32.67 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4533  IS66 Orf2 family protein  34.69 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  33.33 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  32.67 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2890  TnpB protein  34.78 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3090  TnpB protein  34.78 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000926552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>