43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1594 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1594    100 
 
 
1329 bp  2635    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  80.27 
 
 
1572 bp  93.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0710  transposase IS66  82.86 
 
 
729 bp  65.9  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  89.09 
 
 
1515 bp  61.9  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  89.09 
 
 
1515 bp  61.9  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  89.09 
 
 
1515 bp  61.9  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  80.43 
 
 
1530 bp  60  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1167    80.43 
 
 
3476 bp  60  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366883  normal  0.484716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  80.43 
 
 
1530 bp  60  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  80.43 
 
 
1530 bp  60  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  80.43 
 
 
1530 bp  60  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  80.43 
 
 
1530 bp  60  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5957    80.43 
 
 
1182 bp  60  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0111305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  80.43 
 
 
1530 bp  60  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  78.89 
 
 
1101 bp  56  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0744    96.88 
 
 
702 bp  56  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1438    94.29 
 
 
669 bp  54  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0422  transposase IS66  85.48 
 
 
825 bp  52  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  96.67 
 
 
1527 bp  52  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4540  transposase IS66  93.94 
 
 
1014 bp  50.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3593  transposase IS66  93.94 
 
 
1215 bp  50.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.324594  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  84.38 
 
 
1554 bp  48.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  84.38 
 
 
1560 bp  48.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1190  transposase IS66  84.38 
 
 
1308 bp  48.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.808109  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  84.38 
 
 
1560 bp  48.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  91.67 
 
 
1563 bp  48.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  91.67 
 
 
1671 bp  48.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  91.67 
 
 
1608 bp  48.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  91.67 
 
 
1563 bp  48.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  91.67 
 
 
1563 bp  48.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  91.67 
 
 
1563 bp  48.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  91.67 
 
 
1563 bp  48.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  91.67 
 
 
1563 bp  48.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  86.54 
 
 
1536 bp  48.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  91.67 
 
 
1563 bp  48.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  91.67 
 
 
1563 bp  48.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  91.67 
 
 
1563 bp  48.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  91.67 
 
 
1569 bp  48.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  91.67 
 
 
1575 bp  48.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0035    91.67 
 
 
2622 bp  48.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  91.67 
 
 
1536 bp  48.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  100 
 
 
1515 bp  48.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  86.54 
 
 
1536 bp  48.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>