24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2995 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2995    100 
 
 		 1432 bp  2839    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  83.3 
 
 		 1689 bp  299  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3947    87.5 
 
 		 231 bp  198  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3946    80.09 
 
 		 543 bp  172  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  84.15 
 
 		 1575 bp  133  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  84.15 
 
 		 1614 bp  133  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5078  transposase IS66  80.66 
 
 		 840 bp  123  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  82.78 
 
 		 1650 bp  111  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4608  transposase IS66  84.87 
 
 		 1065 bp  93.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0241583  normal  0.199267 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  85.44 
 
 		 1662 bp  85.7  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3195    82.01 
 
 		 1697 bp  77.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  81.01 
 
 		 1623 bp  75.8  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  86.59 
 
 		 1602 bp  75.8  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  85.39 
 
 		 1650 bp  73.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0733  transposase IS66  91.07 
 
 		 1305 bp  71.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4917    97.44 
 
 		 1359 bp  69.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.280499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  85.54 
 
 		 1617 bp  69.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2988    90.74 
 
 		 803 bp  67.9  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  97.22 
 
 		 1671 bp  63.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  93.18 
 
 		 1608 bp  63.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1584  hypothetical protein  87.1 
 
 		 1086 bp  60  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4904    80.75 
 
 		 2921 bp  58  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  80.75 
 
 		 1656 bp  58  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 1590 bp  48.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>