173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4818 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4818  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  354  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.192973 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  100 
 
 
533 aa  208  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  66.67 
 
 
538 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  61.59 
 
 
549 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  67.67 
 
 
551 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  54.84 
 
 
524 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  54.84 
 
 
537 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  55.08 
 
 
549 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  52.32 
 
 
562 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4608  transposase IS66  69.41 
 
 
354 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0241583  normal  0.199267 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  46.83 
 
 
552 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  46.83 
 
 
552 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  46.83 
 
 
552 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  57.94 
 
 
553 aa  99  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0399  transposase IS66  42.86 
 
 
461 aa  94.4  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402856  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  50 
 
 
516 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1584  hypothetical protein  53.7 
 
 
361 aa  87.8  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  43.26 
 
 
520 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  40.88 
 
 
531 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3169  putative IS66 transposase, TnpC  43.66 
 
 
226 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180033  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  37.23 
 
 
531 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  48.11 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  43.18 
 
 
527 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  43.18 
 
 
527 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  43.12 
 
 
556 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5078  transposase IS66  54.05 
 
 
279 aa  72  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1606  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
438 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  44.95 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  44.95 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  44.95 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  44.95 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  44.95 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  44.95 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  44.95 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  44.95 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  44.95 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  46.23 
 
 
512 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  44.95 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  44.95 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  44.95 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  44.95 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  44.95 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  44.95 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  44.95 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  44.95 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  44.95 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  44.95 
 
 
512 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  53.03 
 
 
540 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  45.54 
 
 
537 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  39.42 
 
 
524 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  33.58 
 
 
521 aa  62  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  41.12 
 
 
523 aa  62  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  41.12 
 
 
523 aa  62  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  41.12 
 
 
523 aa  62  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  41.12 
 
 
523 aa  62  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  41.12 
 
 
523 aa  62  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  41.12 
 
 
523 aa  62  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  34.81 
 
 
522 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0036  transposase family  42.06 
 
 
410 aa  62  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  37.3 
 
 
533 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  34.82 
 
 
522 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0023  IS66 family element, transposase  43.56 
 
 
530 aa  59.3  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0065  IS66 family element, transposase  43.56 
 
 
530 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.116785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1847  IS66 family element, transposase  43.56 
 
 
530 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2961  IS66 family element, transposase  43.56 
 
 
530 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.834706  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0015  transposase and inactivated derivatives  39.81 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>