25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4967 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4967    100 
 
 		 372 bp  737    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  91.49 
 
 		 1608 bp  430  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  94.42 
 
 		 1671 bp  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4966  hypothetical protein  100 
 
 		 237 bp  248  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3735    93.48 
 
 		 579 bp  67.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  95.12 
 
 		 450 bp  65.9  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  88.14 
 
 		 1572 bp  61.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0734  hypothetical protein  93.02 
 
 		 186 bp  61.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  91.49 
 
 		 1602 bp  61.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4213    90 
 
 		 261 bp  60  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  90 
 
 		 1689 bp  60  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  86.36 
 
 		 1662 bp  60  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  91.3 
 
 		 1614 bp  60  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  91.3 
 
 		 1575 bp  60  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3797    92.68 
 
 		 447 bp  58  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  87.5 
 
 		 1584 bp  56  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  87.5 
 
 		 1584 bp  56  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4904    89.36 
 
 		 2921 bp  54  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  89.36 
 
 		 1656 bp  54  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4151  posible transposase  88 
 
 		 321 bp  52  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0115322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  85.25 
 
 		 1533 bp  50.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3195    90.24 
 
 		 1697 bp  50.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  91.67 
 
 		 1569 bp  48.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  91.67 
 
 		 1566 bp  48.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  91.67 
 
 		 1650 bp  48.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>