9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6149 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6149    100 
 
 		 144 bp  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.753376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4904    88.55 
 
 		 2921 bp  141  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  88.55 
 
 		 348 bp  141  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  84.5 
 
 		 351 bp  81.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4986    82.95 
 
 		 162 bp  65.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1583  hypothetical protein  92.68 
 
 		 348 bp  58  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  88 
 
 		 348 bp  52  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  84.38 
 
 		 348 bp  48.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  84.38 
 
 		 348 bp  48.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.115753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>