More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1396 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1396  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223414 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  72.59 
 
 		 551 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  73.33 
 
 		 549 aa  201  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  73.33 
 
 		 538 aa  201  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  68.18 
 
 		 533 aa  185  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  60.61 
 
 		 524 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  60.61 
 
 		 537 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  62.22 
 
 		 540 aa  164  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0733  transposase IS66  60.31 
 
 		 434 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  60.74 
 
 		 549 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  59.26 
 
 		 562 aa  160  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  55.7 
 
 		 553 aa  157  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  56.76 
 
 		 552 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  56.76 
 
 		 552 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  56.76 
 
 		 552 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  53.06 
 
 		 556 aa  141  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0399  transposase IS66  55.64 
 
 		 461 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402856  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  53.03 
 
 		 527 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  53.03 
 
 		 527 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  49.66 
 
 		 535 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4608  transposase IS66  62.2 
 
 		 354 aa  101  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0241583  normal  0.199267 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4023  hypothetical protein  47.24 
 
 		 354 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  42.75 
 
 		 508 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1584  hypothetical protein  67.14 
 
 		 361 aa  98.2  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  41.54 
 
 		 537 aa  97.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  48.33 
 
 		 540 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  41.86 
 
 		 520 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  41.79 
 
 		 523 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  41.79 
 
 		 523 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  41.79 
 
 		 523 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  41.79 
 
 		 523 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  41.79 
 
 		 523 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  39.6 
 
 		 537 aa  94  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  41.79 
 
 		 523 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  41.04 
 
 		 523 aa  92.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  45.16 
 
 		 491 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  38.26 
 
 		 537 aa  90.9  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  38.81 
 
 		 530 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1606  IS66 family element, transposase  40.88 
 
 		 438 aa  89  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000125107  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  47.5 
 
 		 545 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  47.5 
 
 		 545 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  47.5 
 
 		 545 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  41.41 
 
 		 510 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  38.26 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  35.17 
 
 		 505 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  35.17 
 
 		 505 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  35.17 
 
 		 505 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  41.79 
 
 		 531 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  71.93 
 
 		 226 aa  85.5  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  45.83 
 
 		 545 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0023  IS66 family element, transposase  41.35 
 
 		 530 aa  85.1  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  41.48 
 
 		 516 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2143  IS66 family element, transposase  41.35 
 
 		 517 aa  85.1  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2961  IS66 family element, transposase  41.35 
 
 		 530 aa  85.1  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.834706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1847  IS66 family element, transposase  41.35 
 
 		 530 aa  85.1  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  42.54 
 
 		 532 aa  85.1  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3899  IS66 family element, transposase  41.35 
 
 		 530 aa  85.1  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0847  IS66 family element, transposase  41.35 
 
 		 530 aa  85.1  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0255  IS66 family element, transposase  41.35 
 
 		 530 aa  85.1  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0906  IS66 family element, transposase  41.35 
 
 		 530 aa  85.1  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1284  IS66 family element, transposase  41.35 
 
 		 530 aa  85.1  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0065  IS66 family element, transposase  41.35 
 
 		 530 aa  85.1  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.116785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4623  IS66 family element, transposase  41.35 
 
 		 530 aa  85.1  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  40.43 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4540  transposase IS66  39.84 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  40.15 
 
 		 527 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>