14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6336 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6336    100 
 
 		 261 bp  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0667339  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  80.28 
 
 		 348 bp  91.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  81.36 
 
 		 348 bp  89.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  81.36 
 
 		 348 bp  89.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4904    87.69 
 
 		 2921 bp  65.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  87.69 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  85.53 
 
 		 354 bp  63.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  85.53 
 
 		 354 bp  63.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  85.53 
 
 		 354 bp  63.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3408  IS66 family transposase  85.53 
 
 		 354 bp  63.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3595  IS66 Orf2 family protein  92.31 
 
 		 348 bp  54  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1583  hypothetical protein  86.44 
 
 		 348 bp  54  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5014  IS66 Orf2 family protein  82.5 
 
 		 348 bp  48.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4976    100 
 
 		 348 bp  46.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>