74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9035 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9035  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9067  transposase  66.38 
 
 		 131 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9071  hypothetical protein  66.38 
 
 		 131 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1282  transposase, IS4 family protein  57.75 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  36.84 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  32.17 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  32.17 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  39.73 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  39.73 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  39.73 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  39.73 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  32.17 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  32.17 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  32.17 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  32.17 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  32.17 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  32.17 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  32.17 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  38.71 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2056  hypothetical protein  39.24 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  35.45 
 
 		 273 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  29.27 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  28.45 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  40.68 
 
 		 253 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  40.68 
 
 		 253 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  40.68 
 
 		 253 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  40.68 
 
 		 253 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  40.68 
 
 		 253 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  29.31 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  29.31 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  29.31 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  29.31 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  29.31 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  43.06 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  29.31 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  35.9 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3272  IS4 family transposase  42.62 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  38.98 
 
 		 122 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0355  IS4 family transposase  42.62 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0436  IS4 family transposase  42.62 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0573  IS4 family transposase  42.62 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2278  IS4 family transposase  42.62 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  42.65 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0921  IS4 family transposase  42.62 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  37.68 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  37.68 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0266  IS4 family transposase  42.62 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2110  IS4 family transposase  42.62 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.305302  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1519  IS4 family transposase  42.62 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0988  IS4 family transposase  42.62 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0936  IS4 family transposase  42.62 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.156092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00500  transposase  30.09 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0738  IS4 family transposase  42.62 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.33 
 
 		 281 aa  42.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  42.86 
 
 		 251 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  42.86 
 
 		 251 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  34.78 
 
 		 131 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 		 129 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 		 129 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  35.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  35.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  35.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  35.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  35.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  35.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  35.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  39.34 
 
 		 121 aa  41.6  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.12 
 
 		 281 aa  41.6  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  35.82 
 
 		 336 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.12 
 
 		 281 aa  41.2  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  35.48 
 
 		 157 aa  41.2  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  28.45 
 
 		 249 aa  41.2  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>