285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9036 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9066  IS298 transposase OrfA  100 
 
 		 104 aa  213  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9036  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  213  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9072  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  213  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  35.42 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  30.93 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  33.33 
 
 		 260 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  42.86 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  42.86 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  42.86 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  42.86 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  42.86 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  42.86 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  39.47 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  41.56 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  29.9 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  29.9 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  29.9 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  29.9 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  29.9 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  36.08 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  36.08 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  36.08 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  31.25 
 
 		 260 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  31.25 
 
 		 260 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  36.08 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  36.08 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33320  transposase  46.77 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36164  transposase protein  46.77 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49860  transposase  46.77 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0351768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09570  transposase  46.77 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23950  transposase protein  46.77 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10830  transposase  46.77 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15020  transposase  46.77 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  42.11 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  38.61 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  41.56 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  41.56 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  41.56 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  34.02 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  34.02 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  34.02 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  34.02 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  34.02 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  34.02 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  34.02 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  34.02 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  34.02 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  34.02 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  34.02 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  34.02 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  34.02 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  34.02 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  34.15 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  30.21 
 
 		 273 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0497  transposase  29.29 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0286  transposase  29.29 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0214  transposase  42.17 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  39.19 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  39.19 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  39.19 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1808  hypothetical protein  42.11 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  39.19 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  39.19 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  39.19 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  39.19 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  39.19 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  39.19 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  34.74 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  34.02 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  32.99 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  31.96 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  32.99 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  32.99 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  33.33 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  34.12 
 
 		 294 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  36.25 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8143  putative transposase  39.51 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05443  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05683  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.723463  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05727  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05595  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750395  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05662  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.953186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05663  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.561044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05664  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.662464  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05679  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.233526  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05685  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05687  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05688  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.833197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05737  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05450  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05439  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05585  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00917315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05594  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127287  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05645  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796652  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05659  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00502  transposase  34.34 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05778  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05779  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05736  ISXoo12 transposase  32.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04143  transposase  32.14 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.935961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>