More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2686 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  100 
 
 
143 aa  291  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  50.41 
 
 
125 aa  140  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  49.59 
 
 
125 aa  136  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  55.36 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.82 
 
 
158 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  48.31 
 
 
121 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  48.31 
 
 
121 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  48.31 
 
 
121 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  42.52 
 
 
149 aa  114  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.48 
 
 
281 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4730  IS298, transposase OrfA  46.55 
 
 
129 aa  110  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  46.96 
 
 
304 aa  103  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  41.18 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  41.18 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.2 
 
 
281 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  42.02 
 
 
132 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.2 
 
 
281 aa  98.2  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  42.02 
 
 
132 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  41.38 
 
 
123 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  41.38 
 
 
123 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  41.38 
 
 
123 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  41.38 
 
 
123 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  41.38 
 
 
123 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 
121 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 
121 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 
121 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  40 
 
 
138 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  36.89 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.28 
 
 
281 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  40.19 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  39.25 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  39.25 
 
 
129 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  39.25 
 
 
129 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  39.25 
 
 
129 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  39.25 
 
 
129 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  39.25 
 
 
129 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  39.25 
 
 
129 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 
121 aa  94  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  42.24 
 
 
260 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  42.24 
 
 
260 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  42.24 
 
 
260 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  45.79 
 
 
254 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  45.79 
 
 
254 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  45.79 
 
 
254 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  46.73 
 
 
254 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  39.64 
 
 
181 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  45.79 
 
 
254 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  39.64 
 
 
181 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  39.64 
 
 
181 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  39.64 
 
 
181 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  39.64 
 
 
181 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  45.79 
 
 
254 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.61 
 
 
252 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  46.73 
 
 
254 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  43.1 
 
 
260 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  46.73 
 
 
254 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  46.73 
 
 
254 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  45.79 
 
 
254 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  46.73 
 
 
254 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  41.96 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  40.91 
 
 
122 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  41.96 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  39.29 
 
 
123 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  39.29 
 
 
123 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  40.91 
 
 
122 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  39.29 
 
 
123 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  39.47 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  39.47 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  39.47 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  39.47 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  34.68 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  38.78 
 
 
259 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  39.47 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  39.47 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  40.71 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3086  putative transposase  50 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  39.66 
 
 
110 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  34.43 
 
 
126 aa  90.1  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2661  hypothetical protein  52.78 
 
 
170 aa  90.5  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0335597  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  34.43 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  43.24 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  40.91 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  40.91 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  39.13 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  38.26 
 
 
132 aa  86.7  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  38.26 
 
 
132 aa  86.7  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  38.26 
 
 
132 aa  86.7  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  38.26 
 
 
132 aa  86.7  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  38.26 
 
 
132 aa  86.7  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.63 
 
 
252 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>