More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4008 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  100 
 
 		 138 aa  283  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  91.24 
 
 		 138 aa  259  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  91.24 
 
 		 138 aa  259  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4670  hypothetical protein  66.91 
 
 		 176 aa  174  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  63.08 
 
 		 181 aa  171  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  63.08 
 
 		 181 aa  171  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  63.08 
 
 		 181 aa  171  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  63.08 
 
 		 181 aa  171  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  63.08 
 
 		 181 aa  171  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3439  IS1647-like transposase  52.63 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4462  IS1647-like transposase  55.1 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  46.55 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  45.05 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  45.69 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  40 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3086  putative transposase  46.36 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  44.74 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  44.74 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  44.74 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  44.74 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  44.74 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4730  IS298, transposase OrfA  42.24 
 
 		 129 aa  93.6  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  43.48 
 
 		 304 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  41.96 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  41.96 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  41.96 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  42.34 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  42.34 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  42.34 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  42.34 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  42.34 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  42.34 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  42.11 
 
 		 260 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  42.11 
 
 		 260 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  42.11 
 
 		 260 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  42.11 
 
 		 260 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  43.75 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  43.93 
 
 		 254 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  43.93 
 
 		 254 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  43.93 
 
 		 254 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  43.93 
 
 		 254 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  43.93 
 
 		 254 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.29 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  45.79 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  45.79 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  45.79 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  35.48 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  35.48 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  35.48 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  42.86 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  40.18 
 
 		 260 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  42.86 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.04 
 
 		 252 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  35.48 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  35.48 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  36.29 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  35.48 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  35.48 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  39.29 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  41.96 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  41.96 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  39.47 
 
 		 252 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  39.47 
 
 		 252 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  39.47 
 
 		 252 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  39.47 
 
 		 252 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  39.47 
 
 		 252 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  39.47 
 
 		 252 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  39.47 
 
 		 252 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  39.47 
 
 		 252 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  39.47 
 
 		 252 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  42.06 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  41.96 
 
 		 260 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  41.96 
 
 		 260 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  39.67 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  43.93 
 
 		 254 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  43.93 
 
 		 254 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  39.25 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  43.93 
 
 		 254 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  43.93 
 
 		 254 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  43.93 
 
 		 254 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  43.93 
 
 		 254 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  38.74 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  40.37 
 
 		 253 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  40.37 
 
 		 253 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  40.37 
 
 		 253 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  40.37 
 
 		 253 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  40 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  37.72 
 
 		 252 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  42.99 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  42.99 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  37.01 
 
 		 254 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  37.01 
 
 		 253 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  37.01 
 
 		 253 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  41.96 
 
 		 273 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  42.99 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  39.47 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  38.26 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  38.32 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02496  hypothetical protein  36.89 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  36.22 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>