More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2507 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  99.2 
 
 		 125 aa  253  9e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  58.14 
 
 		 139 aa  157  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  49.59 
 
 		 143 aa  136  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4730  IS298, transposase OrfA  45.16 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  50.88 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  50.88 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  50.88 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.67 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3086  putative transposase  50.41 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  45 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 		 304 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  43.64 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2661  hypothetical protein  64 
 
 		 170 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0335597  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  44.04 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  44.04 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  44.04 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  44.04 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  44.04 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  44.04 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  42.73 
 
 		 135 aa  105  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  49.58 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  49.58 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  42.73 
 
 		 135 aa  105  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  46.55 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  46.55 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  47.75 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  47.75 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  49.07 
 
 		 254 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  44.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  44.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  44.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  44.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  44.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  44.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  44.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  44.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  44.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  44.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  49.07 
 
 		 254 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  49.07 
 
 		 254 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  49.07 
 
 		 254 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  49.07 
 
 		 254 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  45.05 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  44.17 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  45.05 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  45.05 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  45.69 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  44.17 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  44.17 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  45.08 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  45.08 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  46.85 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  45.08 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  45.08 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  45.08 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.28 
 
 		 252 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  49.07 
 
 		 254 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  49.07 
 
 		 254 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  49.07 
 
 		 254 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  49.07 
 
 		 254 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  49.07 
 
 		 254 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  49.07 
 
 		 254 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  49.04 
 
 		 303 aa  98.6  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  49.04 
 
 		 303 aa  98.6  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  49.04 
 
 		 303 aa  98.6  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3276  transposase  48.18 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  39.83 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  46.3 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  46.3 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  45.95 
 
 		 181 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  45.95 
 
 		 181 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  45.95 
 
 		 181 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  45.95 
 
 		 181 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  45.95 
 
 		 181 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0286  transposase  45.19 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0497  transposase  45.19 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.16 
 
 		 281 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  40.34 
 
 		 260 aa  90.9  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  44.25 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2821  ISBm1, transposase orfA  47.25 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  40.34 
 
 		 260 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  40.34 
 
 		 260 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  38.94 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  38.94 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  40.34 
 
 		 273 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  43.75 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  43.75 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  43.75 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  38.94 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  51.85 
 
 		 294 aa  87  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  39.66 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  39.66 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  39.66 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  39.66 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  39.66 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  39.66 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  39.66 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  39.66 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  39.66 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>