More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2821 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2821  ISBm1, transposase orfA  100 
 
 
87 aa  180  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  98.85 
 
 
121 aa  178  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  97.7 
 
 
121 aa  178  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  98.85 
 
 
121 aa  178  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  98.85 
 
 
121 aa  178  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  98.85 
 
 
121 aa  178  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  98.85 
 
 
121 aa  178  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  97.7 
 
 
121 aa  178  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  97.7 
 
 
121 aa  178  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  98.85 
 
 
121 aa  178  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  98.85 
 
 
121 aa  178  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  97.7 
 
 
121 aa  176  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  97.7 
 
 
121 aa  176  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  97.7 
 
 
121 aa  176  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  80.25 
 
 
252 aa  147  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  81.4 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  81.4 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  72.41 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  72.41 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  70.11 
 
 
142 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  70.11 
 
 
142 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  77.92 
 
 
254 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  77.92 
 
 
254 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  77.92 
 
 
254 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  77.92 
 
 
254 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  77.92 
 
 
254 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  77.92 
 
 
254 aa  133  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  77.92 
 
 
254 aa  133  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  77.92 
 
 
254 aa  133  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  77.92 
 
 
254 aa  133  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  77.92 
 
 
254 aa  133  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  77.92 
 
 
254 aa  133  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  72.5 
 
 
123 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  72.5 
 
 
123 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  72.5 
 
 
123 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  71.6 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  59.76 
 
 
123 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  59.76 
 
 
123 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  59.76 
 
 
123 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  59.76 
 
 
123 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  59.76 
 
 
123 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  59.04 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  59.04 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  59.04 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6488  transposase  71.43 
 
 
103 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  48.35 
 
 
125 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  50 
 
 
121 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  50 
 
 
121 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  50 
 
 
121 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  47.25 
 
 
125 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  52.38 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.12 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  45.68 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  45.68 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  45.68 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  47.44 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  45.68 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  45.68 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  45.68 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  44.58 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  45.12 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  45.12 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0214  transposase  45.12 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  45.12 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  45.12 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  45.12 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  45.12 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  45.12 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  45.12 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  45.12 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  45.12 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  45.12 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  45.12 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  45.12 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  45.12 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  48.15 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  45.35 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  45.35 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  40.91 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  38.55 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.5 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  38.55 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  38.55 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  38.55 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  43.02 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  40.96 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.04 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.04 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  43.37 
 
 
252 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  43.37 
 
 
252 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.53 
 
 
281 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  41.25 
 
 
255 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  44.05 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  38.75 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  44.19 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  46.25 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  42.86 
 
 
157 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  41.25 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  41.67 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  33.72 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>