More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5636 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  81.35 
 
 
252 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  81.35 
 
 
252 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  100 
 
 
167 aa  279  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  53.17 
 
 
251 aa  257  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  52.4 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  52.4 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  47.47 
 
 
336 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  45.97 
 
 
260 aa  204  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  47.83 
 
 
260 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  47.83 
 
 
260 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  47.83 
 
 
273 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  83.81 
 
 
141 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  43.21 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  43.21 
 
 
260 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  43.21 
 
 
260 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  43.21 
 
 
260 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  41.13 
 
 
259 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  43.37 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  43.37 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  43.37 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  43.37 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  43.37 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  43.37 
 
 
254 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  43.37 
 
 
254 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  43.37 
 
 
254 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  43.37 
 
 
254 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  43.37 
 
 
254 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  43.37 
 
 
254 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  36.69 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  36.69 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  36.69 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  36.69 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  38.62 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  37.8 
 
 
249 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.57 
 
 
252 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  39.44 
 
 
266 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  39.09 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  38.11 
 
 
255 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  53.54 
 
 
142 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  51.37 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  51.37 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  51.37 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  51.37 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  51.37 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  51.37 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  51.37 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  51.37 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  51.37 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  51.37 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  51.37 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  36.16 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  51.37 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  62.73 
 
 
659 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  34.44 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  47.68 
 
 
186 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  47.68 
 
 
186 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  50.68 
 
 
190 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  33.87 
 
 
252 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  34.02 
 
 
250 aa  142  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  34.02 
 
 
250 aa  142  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  35.39 
 
 
252 aa  142  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  35.39 
 
 
252 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  35.39 
 
 
252 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  35.39 
 
 
252 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  35.39 
 
 
252 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  35.39 
 
 
252 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  35.39 
 
 
252 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  47.02 
 
 
186 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  35.39 
 
 
252 aa  142  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  35.39 
 
 
252 aa  142  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  52.71 
 
 
129 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  52.71 
 
 
129 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  33.47 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  34.27 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  34.27 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  51.94 
 
 
129 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  51.94 
 
 
129 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  51.94 
 
 
129 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  34.27 
 
 
253 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  51.94 
 
 
129 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  51.94 
 
 
129 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  51.94 
 
 
129 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  51.94 
 
 
129 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  34.27 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  34.27 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  36.01 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.55 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  51.16 
 
 
129 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  34.02 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  51.16 
 
 
129 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  53.7 
 
 
144 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.26 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.17 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  51.94 
 
 
129 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  51.94 
 
 
129 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  33.47 
 
 
249 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.26 
 
 
281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  53.98 
 
 
141 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>