More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2960 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 336 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  99.32 
 
 		 190 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  99.32 
 
 		 190 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  99.32 
 
 		 190 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  99.32 
 
 		 190 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  99.32 
 
 		 190 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  99.32 
 
 		 190 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  99.32 
 
 		 190 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  99.32 
 
 		 190 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  99.32 
 
 		 190 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  99.32 
 
 		 190 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  99.32 
 
 		 190 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  99.32 
 
 		 190 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  98.65 
 
 		 190 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 129 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 129 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 129 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  99.22 
 
 		 129 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  99.22 
 
 		 129 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4301  hypothetical protein  98.44 
 
 		 136 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0174  hypothetical protein  96.18 
 
 		 147 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4295  hypothetical protein  99.21 
 
 		 133 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  77.33 
 
 		 186 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  77.33 
 
 		 186 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  77.33 
 
 		 186 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  47.47 
 
 		 252 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  47.47 
 
 		 252 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0827  hypothetical protein  90.55 
 
 		 175 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.272641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  46.69 
 
 		 252 aa  238  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  46.69 
 
 		 252 aa  238  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  86.05 
 
 		 129 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  86.05 
 
 		 129 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.31 
 
 		 251 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3696  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  0.614374 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3822  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0172  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4289  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3531  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0201586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3539  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.72102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  82.95 
 
 		 129 aa  233  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  82.95 
 
 		 129 aa  233  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  82.95 
 
 		 129 aa  233  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  86.05 
 
 		 129 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  86.05 
 
 		 129 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  48.43 
 
 		 251 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  82.17 
 
 		 129 aa  229  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  48.43 
 
 		 251 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  80.62 
 
 		 129 aa  225  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4122  hypothetical protein  81.08 
 
 		 206 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  79.07 
 
 		 129 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  79.07 
 
 		 129 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1839  transposase, IS4 family protein  81.08 
 
 		 206 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0168  transposase, IS4 family protein  99.07 
 
 		 201 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2296  transposase  80 
 
 		 142 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4094  IS5 family transposase OrfA  85.96 
 
 		 117 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378853  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0174  IS4 family transposase  79.07 
 
 		 129 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3757  IS5 family transposase OrfA  86.73 
 
 		 115 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  0.26823 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4033  IS5 family transposase OrfA  86.73 
 
 		 115 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1007  IS5 family transposase OrfA  81.25 
 
 		 123 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2059  IS5 family transposase OrfA  81.25 
 
 		 123 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5031  hypothetical protein  79.82 
 
 		 115 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.212133  normal  0.750276 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5038  hypothetical protein  79.82 
 
 		 115 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799409  normal  0.881755 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4639  IS5 family transposase OrfA  81.25 
 
 		 117 aa  192  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0507  IS5 family transposase  78.95 
 
 		 115 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1529  IS5 family transposase  78.95 
 
 		 115 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2759  IS5 family transposase  78.95 
 
 		 115 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4649  IS5 family transposase OrfA  80.36 
 
 		 117 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0173  IS5 family transposase  84.31 
 
 		 104 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3697  IS66 Orf2 family protein  98.86 
 
 		 100 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  42.29 
 
 		 266 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  40 
 
 		 254 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  40 
 
 		 254 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  40 
 
 		 254 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  40 
 
 		 254 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  40 
 
 		 254 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  39.69 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  39.69 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  39.69 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  39.69 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  58.02 
 
 		 131 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  39 
 
 		 260 aa  169  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  38.96 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  38.96 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  38.96 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  38.96 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  38.96 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  38.96 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  56.8 
 
 		 146 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  36.96 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.74 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4160  response regulator receiver protein  77.27 
 
 		 110 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  38.17 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  34.96 
 
 		 255 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  37.86 
 
 		 260 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  37.86 
 
 		 260 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>