More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00557 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  100 
 
 
249 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  99.6 
 
 
253 aa  519  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  99.6 
 
 
253 aa  519  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  99.2 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  99.2 
 
 
249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  75.5 
 
 
249 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  73.09 
 
 
252 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  73.09 
 
 
252 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  73.09 
 
 
252 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  73.09 
 
 
252 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  73.09 
 
 
252 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  73.09 
 
 
252 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  72.69 
 
 
252 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  72.69 
 
 
252 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  72.69 
 
 
252 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  69.88 
 
 
252 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02496  hypothetical protein  99.35 
 
 
156 aa  316  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00500  transposase  99.21 
 
 
126 aa  266  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  50 
 
 
245 aa  249  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01472  ISSod6, transposase  66.26 
 
 
173 aa  229  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01489  ISSod6, transposase  66.26 
 
 
173 aa  229  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  46.18 
 
 
250 aa  224  8e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  46.18 
 
 
250 aa  224  8e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  45.97 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00502  transposase  93.52 
 
 
112 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02495  hypothetical protein  98.98 
 
 
102 aa  208  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  39.92 
 
 
253 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  39.92 
 
 
253 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  39.92 
 
 
253 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  39.92 
 
 
253 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  43.67 
 
 
255 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  39.39 
 
 
253 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.6 
 
 
252 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  35.92 
 
 
254 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  35.92 
 
 
254 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  35.92 
 
 
254 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  35.92 
 
 
254 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  35.92 
 
 
254 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  35.22 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  35.22 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  35.22 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  35.22 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  35.22 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  35.22 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  33.46 
 
 
266 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.46 
 
 
281 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  34.44 
 
 
251 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.05 
 
 
281 aa  148  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  33.86 
 
 
260 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  33.86 
 
 
260 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  33.86 
 
 
260 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  39.11 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  34.8 
 
 
303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  33.86 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  34.8 
 
 
303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  34.8 
 
 
303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  36.84 
 
 
249 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.63 
 
 
281 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.65 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  32.68 
 
 
260 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  37.38 
 
 
235 aa  141  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  35.14 
 
 
255 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.79 
 
 
252 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.79 
 
 
252 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  34.75 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  30.8 
 
 
259 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  34.27 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  34.27 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  32.67 
 
 
251 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  32.67 
 
 
251 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0244  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0187  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0325  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.74 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  31.1 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  31.1 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  28.92 
 
 
304 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  31.76 
 
 
336 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  29.51 
 
 
294 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  31.47 
 
 
273 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2056  hypothetical protein  46.55 
 
 
124 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  31.4 
 
 
244 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2291  hypothetical protein  49.04 
 
 
155 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  37.96 
 
 
142 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  37.96 
 
 
142 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  35.71 
 
 
210 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  35.71 
 
 
210 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  35.71 
 
 
210 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  34.03 
 
 
157 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  36.88 
 
 
164 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0794  hypothetical protein  72.88 
 
 
96 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.906116  hitchhiker  0.00155993 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  39.01 
 
 
177 aa  98.6  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  39.01 
 
 
177 aa  98.6  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  39.01 
 
 
177 aa  98.6  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  39.01 
 
 
177 aa  98.6  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  39.01 
 
 
177 aa  98.6  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  36.17 
 
 
164 aa  98.2  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  36.17 
 
 
164 aa  98.2  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>