More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6122 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  100 
 
 
141 aa  286  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  91.13 
 
 
251 aa  233  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  91.13 
 
 
251 aa  233  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  71.88 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  71.65 
 
 
130 aa  168  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  70.19 
 
 
172 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  58.54 
 
 
142 aa  143  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  58.33 
 
 
251 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  51.09 
 
 
659 aa  130  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  50.79 
 
 
144 aa  130  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  53.98 
 
 
252 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  53.98 
 
 
252 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  53.1 
 
 
252 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  53.1 
 
 
252 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  51.43 
 
 
141 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0507  IS5 family transposase  55.77 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1529  IS5 family transposase  55.77 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2759  IS5 family transposase  55.77 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5031  hypothetical protein  52.88 
 
 
115 aa  114  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.212133  normal  0.750276 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5038  hypothetical protein  52.88 
 
 
115 aa  114  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799409  normal  0.881755 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4639  IS5 family transposase OrfA  53.33 
 
 
117 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  54.81 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4649  IS5 family transposase OrfA  52.38 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1007  IS5 family transposase OrfA  48.78 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2059  IS5 family transposase OrfA  48.78 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2136  IS5 family transposase OrfA  54.81 
 
 
122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3263  IS5 family transposase OrfA  54.81 
 
 
122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  49.57 
 
 
336 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0174  hypothetical protein  52.43 
 
 
147 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4301  hypothetical protein  48.74 
 
 
136 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4295  hypothetical protein  48.74 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3531  hypothetical protein  48.74 
 
 
119 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0201586  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3822  hypothetical protein  48.74 
 
 
119 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372887  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  49.57 
 
 
307 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0827  hypothetical protein  52.43 
 
 
175 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.272641  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3539  hypothetical protein  48.74 
 
 
119 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.72102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0420  transposase  49.18 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0598  transposase  49.18 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0172  hypothetical protein  48.74 
 
 
119 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0837  transposase  49.18 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.456928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1299  transposase  49.18 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.594547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1320  transposase  49.18 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1526  transposase  49.18 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1642  transposase  49.18 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1646  transposase  49.18 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1688  transposase  49.18 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2028  transposase  49.18 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2348  transposase  49.18 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00257505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2459  transposase  49.18 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2607  transposase  49.18 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3696  hypothetical protein  48.74 
 
 
119 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  0.614374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1595  IS5 family transposase OrfA  53.85 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4289  hypothetical protein  48.74 
 
 
119 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  56.57 
 
 
104 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  56.57 
 
 
104 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  56.57 
 
 
104 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  50.42 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  50.42 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  50.42 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  50.42 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  50.42 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3757  IS5 family transposase OrfA  53.4 
 
 
115 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  0.26823 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4033  IS5 family transposase OrfA  53.4 
 
 
115 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4094  IS5 family transposase OrfA  52.43 
 
 
117 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378853  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2771  transposase  49.04 
 
 
128 aa  103  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.447174  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  49.04 
 
 
122 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  49.11 
 
 
132 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  49.11 
 
 
132 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  49.04 
 
 
122 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  44.03 
 
 
142 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  44.03 
 
 
142 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  44.03 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  44.03 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.57 
 
 
252 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  49.53 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  49.53 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  49.53 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  45.79 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  47.06 
 
 
254 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  47.06 
 
 
254 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  47.06 
 
 
254 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  47.06 
 
 
254 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  47.06 
 
 
254 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  43.9 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  43.9 
 
 
121 aa  92  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  43.9 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  43.9 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  43.9 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  43.9 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  43.9 
 
 
121 aa  92  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  43.9 
 
 
121 aa  92  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  43.9 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  43.9 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0173  IS5 family transposase  48.94 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  43.9 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  43.9 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  47 
 
 
254 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  47 
 
 
254 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  47 
 
 
254 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  47 
 
 
254 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>