More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3738 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 
251 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  53.17 
 
 
252 aa  257  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  53.17 
 
 
252 aa  257  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  53.57 
 
 
252 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  53.57 
 
 
252 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  51.82 
 
 
251 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  51.82 
 
 
251 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  45.31 
 
 
336 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  43.5 
 
 
260 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  43.5 
 
 
260 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  43.5 
 
 
260 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  43.5 
 
 
260 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  40.65 
 
 
260 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  43.9 
 
 
254 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  43.9 
 
 
254 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  43.9 
 
 
254 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  43.9 
 
 
254 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  43.9 
 
 
254 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  43.04 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  43.72 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  43.72 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  43.03 
 
 
254 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  43.03 
 
 
254 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  43.03 
 
 
254 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  43.03 
 
 
254 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  43.03 
 
 
254 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  43.03 
 
 
254 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  41.7 
 
 
266 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.77 
 
 
252 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  36.14 
 
 
255 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  36.03 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  36.03 
 
 
253 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  36.03 
 
 
253 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  36.03 
 
 
253 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  35.48 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  36.73 
 
 
249 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  36.73 
 
 
249 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  35.96 
 
 
294 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  35.1 
 
 
245 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  33.2 
 
 
253 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  60.19 
 
 
144 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.19 
 
 
281 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  59.26 
 
 
659 aa  142  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  33.2 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.63 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  33.2 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  33.2 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  33.2 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  33.2 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  33.2 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  33.2 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  33.2 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  33.2 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  51.97 
 
 
142 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.67 
 
 
281 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.9 
 
 
281 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  30.28 
 
 
249 aa  135  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  35.89 
 
 
251 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  40.11 
 
 
190 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  40.11 
 
 
190 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  40.11 
 
 
190 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  40.11 
 
 
190 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  40.11 
 
 
190 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  40.11 
 
 
190 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  40.11 
 
 
190 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  40.11 
 
 
190 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  40.11 
 
 
190 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  40.11 
 
 
190 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  40.11 
 
 
190 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  40.11 
 
 
190 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  31.33 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  39.55 
 
 
190 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  33.1 
 
 
303 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  33.1 
 
 
303 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  33.1 
 
 
303 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  58.33 
 
 
141 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  32.53 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  32.53 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  32.74 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  57.69 
 
 
141 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  32.74 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  32.74 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  32.74 
 
 
253 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  32.74 
 
 
253 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  33.47 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  33.47 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  31.71 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  60.75 
 
 
130 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
186 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  32.19 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
186 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  33.04 
 
 
254 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
186 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  31.86 
 
 
249 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  45.86 
 
 
138 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0187  hypothetical protein  31.89 
 
 
255 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0244  hypothetical protein  31.89 
 
 
255 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2771  transposase  49.52 
 
 
128 aa  122  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.447174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0325  hypothetical protein  31.89 
 
 
255 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  36.77 
 
 
244 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>