More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5627 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  98.82 
 
 		 255 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0187  hypothetical protein  92.16 
 
 		 255 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0244  hypothetical protein  92.16 
 
 		 255 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0325  hypothetical protein  92.16 
 
 		 255 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0767  transposase IS4 family protein  86.18 
 
 		 123 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0768  transposase  95.37 
 
 		 133 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3680  transposase  86.73 
 
 		 98 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  36.72 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  37.65 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  36.58 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  36.58 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  36.58 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  36.58 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  36.58 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  36.58 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  36.58 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  36.58 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  36.58 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  36.58 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  33.59 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  35.52 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  35.52 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  35.14 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  35.14 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  35.14 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  34.75 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  35.02 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  35.02 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  35.02 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  35.02 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  34.36 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  34.88 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  37.24 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  36.47 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  36.36 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  37.24 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  36.36 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  36.36 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  36.47 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  36.36 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  36.36 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  36.76 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  36.76 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  36.76 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  36.76 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  36.76 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  36.76 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.66 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.36 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.72 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  36.55 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  33.2 
 
 		 336 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  34.38 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  34.38 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  34.38 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  34.38 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  31.51 
 
 		 303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  31.51 
 
 		 303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  31.51 
 
 		 303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  34.38 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  33.86 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  30.62 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  30.62 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  28.24 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  32.41 
 
 		 304 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  34.26 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2966  transposase  58.33 
 
 		 120 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372879  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  34.26 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  28.24 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.81 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.81 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  28.79 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3679  transposase  80.82 
 
 		 86 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  31.8 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  30.34 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  34.53 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0127  hypothetical protein  80.95 
 
 		 85 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  32.02 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  30.68 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  38.93 
 
 		 171 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02496  hypothetical protein  34.94 
 
 		 156 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  39.86 
 
 		 171 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  39.86 
 
 		 171 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  37.27 
 
 		 177 aa  95.5  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  40.88 
 
 		 142 aa  95.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  40.88 
 
 		 142 aa  95.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01489  ISSod6, transposase  35.54 
 
 		 173 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  37.65 
 
 		 176 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  37.65 
 
 		 176 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01472  ISSod6, transposase  35.54 
 
 		 173 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  37.65 
 
 		 176 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  37.65 
 
 		 176 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  34.73 
 
 		 190 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  38.22 
 
 		 188 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  34.73 
 
 		 190 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  34.73 
 
 		 190 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>