More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3793 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  65.6 
 
 
254 aa  332  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  65.6 
 
 
254 aa  332  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  65.6 
 
 
254 aa  332  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  65.6 
 
 
254 aa  332  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  65.6 
 
 
254 aa  332  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  65.6 
 
 
254 aa  332  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  64.4 
 
 
254 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  64.4 
 
 
254 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  64.4 
 
 
254 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  64.4 
 
 
254 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  64.4 
 
 
254 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  75 
 
 
142 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  75 
 
 
142 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  46.85 
 
 
251 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  46.85 
 
 
251 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  67.55 
 
 
210 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  67.55 
 
 
210 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  66.89 
 
 
210 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  43.14 
 
 
260 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  42.51 
 
 
255 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  41.73 
 
 
260 aa  191  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  41.73 
 
 
260 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  41.73 
 
 
260 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  41.73 
 
 
260 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  78.7 
 
 
121 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  77.78 
 
 
121 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  78.7 
 
 
121 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  78.7 
 
 
121 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  78.7 
 
 
121 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  78.7 
 
 
121 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  77.78 
 
 
121 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  77.78 
 
 
121 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  78.7 
 
 
121 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  78.7 
 
 
121 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.73 
 
 
251 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  77.78 
 
 
121 aa  185  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  77.78 
 
 
121 aa  185  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  77.78 
 
 
121 aa  184  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.4 
 
 
252 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.4 
 
 
252 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  41.04 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  61.59 
 
 
138 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  40.47 
 
 
259 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  42.91 
 
 
260 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  42.91 
 
 
260 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  39.92 
 
 
336 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  43.22 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  38.49 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  38.49 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  38.49 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  38.49 
 
 
253 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  67.77 
 
 
127 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  40.96 
 
 
252 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  40.96 
 
 
252 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  37.45 
 
 
252 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  37.45 
 
 
252 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  37.45 
 
 
252 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  37.45 
 
 
252 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  37.45 
 
 
252 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  37.45 
 
 
252 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  37.45 
 
 
252 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  37.45 
 
 
252 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  37.45 
 
 
252 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  35.32 
 
 
253 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  35.32 
 
 
253 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  35.32 
 
 
253 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  67.24 
 
 
132 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  67.24 
 
 
132 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  35.22 
 
 
249 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  35.22 
 
 
249 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.86 
 
 
281 aa  164  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  58.78 
 
 
131 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  68.57 
 
 
142 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  68.57 
 
 
142 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  35.18 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  34.41 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  34.8 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  35.63 
 
 
249 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  38.71 
 
 
251 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  65.71 
 
 
123 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  65.71 
 
 
123 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  65.71 
 
 
123 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  65.71 
 
 
142 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.2 
 
 
281 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  37.99 
 
 
253 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.43 
 
 
281 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  65.38 
 
 
142 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  65.38 
 
 
142 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  59.42 
 
 
138 aa  155  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  59.42 
 
 
138 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.84 
 
 
281 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  33.33 
 
 
294 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  32.54 
 
 
249 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  35.08 
 
 
245 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2821  ISBm1, transposase orfA  80.25 
 
 
87 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  35.2 
 
 
249 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  37.72 
 
 
249 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  36.33 
 
 
255 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  36.33 
 
 
255 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>