More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21600  transposase  100 
 
 		 294 aa  597  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  43.92 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  42.14 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  42.14 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  42.14 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  56.71 
 
 		 177 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  36.58 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.71 
 
 		 281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.05 
 
 		 281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.36 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  39.19 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  39.19 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.37 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  52.27 
 
 		 184 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  52.27 
 
 		 184 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  34.68 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  37.07 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  37.07 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  37.07 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  37.07 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  37.07 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  37.07 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  36.73 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  36.73 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  36.73 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  36.73 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  36.73 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  34.34 
 
 		 260 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  34.34 
 
 		 260 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  34.34 
 
 		 260 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  39.07 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.96 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  51.57 
 
 		 158 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  44.79 
 
 		 287 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  36.55 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  36.55 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  30.48 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  50.63 
 
 		 188 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.66 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  30.45 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  30.45 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  30.45 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  30.45 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  30.45 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  30.45 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  30.45 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  30.45 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  30.45 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  31.47 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  29.45 
 
 		 252 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  32.53 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  35.44 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  35.44 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.05 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.05 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  28.47 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  28.47 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  30.58 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  34.07 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  29.86 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  29.9 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  29.9 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  29.86 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  29.9 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  29.45 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  28.03 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  30.14 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  27.15 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  29.17 
 
 		 249 aa  122  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  28.08 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  54.14 
 
 		 136 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4009  transposase, IS4  49.62 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  30.85 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  30.85 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  30.85 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  30.85 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  29.66 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  41.82 
 
 		 171 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  41.82 
 
 		 171 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  41.82 
 
 		 171 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  29.83 
 
 		 253 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  30.34 
 
 		 255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5459  transposase IS4 family protein  40.49 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00365854  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  50 
 
 		 139 aa  109  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  50 
 
 		 139 aa  109  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  41.25 
 
 		 177 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  41.25 
 
 		 177 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  41.25 
 
 		 177 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  41.25 
 
 		 177 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  41.25 
 
 		 177 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  49.28 
 
 		 139 aa  108  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  49.28 
 
 		 139 aa  108  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  49.28 
 
 		 139 aa  108  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  49.28 
 
 		 139 aa  108  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  49.28 
 
 		 139 aa  108  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  42.77 
 
 		 151 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  42.77 
 
 		 151 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  42.77 
 
 		 151 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  37.36 
 
 		 176 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  37.36 
 
 		 176 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>