More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1158 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1158  transposase  100 
 
 		 138 aa  280  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  99.24 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  100 
 
 		 102 aa  207  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  70.59 
 
 		 254 aa  199  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  70.59 
 
 		 254 aa  199  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  70.59 
 
 		 254 aa  199  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  70.59 
 
 		 254 aa  199  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  70.59 
 
 		 254 aa  199  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  70.59 
 
 		 254 aa  199  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  69.85 
 
 		 254 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  69.85 
 
 		 254 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  69.85 
 
 		 254 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  69.85 
 
 		 254 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  69.85 
 
 		 254 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  71.74 
 
 		 138 aa  184  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  71.74 
 
 		 138 aa  184  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  61.76 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  61.76 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  57.35 
 
 		 210 aa  165  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  57.35 
 
 		 210 aa  165  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  59.54 
 
 		 252 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  57.35 
 
 		 210 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1127  ISBm1, transposase orfB  71.72 
 
 		 102 aa  153  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  52.07 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  51.85 
 
 		 177 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  51.85 
 
 		 177 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  51.85 
 
 		 177 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  51.85 
 
 		 177 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  51.85 
 
 		 177 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  49.63 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  49.63 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  48.89 
 
 		 176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  48.89 
 
 		 176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.86 
 
 		 251 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  51.54 
 
 		 251 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  51.54 
 
 		 251 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  45.59 
 
 		 260 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  45.59 
 
 		 253 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  45.19 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  45.59 
 
 		 253 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  45.59 
 
 		 253 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  45.59 
 
 		 253 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  45.59 
 
 		 253 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  43.71 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  42.34 
 
 		 260 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  44.62 
 
 		 255 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  42.34 
 
 		 260 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  42.34 
 
 		 260 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  42.34 
 
 		 260 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0528  ISBm1, transposase orfB, interruption-C  73.24 
 
 		 79 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.300316  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  43.05 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  43.05 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  46.09 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  46.09 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  46.09 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  46.09 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  46.09 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  41.51 
 
 		 177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  43.38 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  43.85 
 
 		 336 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  44.12 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  43.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  43.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  43.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  43.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  43.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  43.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  43.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  43.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  43.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  43.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  43.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  43.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  41.73 
 
 		 250 aa  107  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  41.73 
 
 		 250 aa  107  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  40.58 
 
 		 249 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  43.08 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  43.38 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  43.38 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  43.38 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  43.38 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  40.3 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  41.91 
 
 		 249 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  40.3 
 
 		 186 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  40.3 
 
 		 186 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  41.91 
 
 		 249 aa  103  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  42.03 
 
 		 266 aa  103  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.79 
 
 		 281 aa  103  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.47 
 
 		 281 aa  102  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.11 
 
 		 281 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.13 
 
 		 281 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  51.82 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  40.15 
 
 		 259 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  51.82 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  46.28 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  43.95 
 
 		 287 aa  101  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  46.28 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  46.28 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  46.28 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  46.28 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>