More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1979 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  100 
 
 
304 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  47.06 
 
 
303 aa  232  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  47.06 
 
 
303 aa  232  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  47.06 
 
 
303 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  43.92 
 
 
294 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.8 
 
 
281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  35.52 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  52.41 
 
 
177 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  36.05 
 
 
260 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  36.05 
 
 
260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  36.05 
 
 
260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  36.05 
 
 
260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.49 
 
 
281 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.15 
 
 
281 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.47 
 
 
281 aa  158  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  36.03 
 
 
260 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  36.03 
 
 
260 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  49.42 
 
 
184 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  49.42 
 
 
184 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  50.92 
 
 
188 aa  149  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  33.67 
 
 
253 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  36.03 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  33.67 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  33.67 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  33.67 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  35.84 
 
 
254 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  35.84 
 
 
254 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  35.84 
 
 
254 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  35.84 
 
 
254 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  35.84 
 
 
254 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  35.84 
 
 
254 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  35.15 
 
 
254 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  35.15 
 
 
254 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  35.15 
 
 
254 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  35.15 
 
 
254 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  35.15 
 
 
254 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  35.54 
 
 
259 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  32.76 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  32.76 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  32.76 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  32.76 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  32.76 
 
 
252 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  32.76 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  32.76 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  32.76 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  32.76 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  33.7 
 
 
255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4009  transposase, IS4  52.03 
 
 
256 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  29.97 
 
 
254 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  28.92 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  28.92 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  27.87 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  28.92 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  30.61 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  28.92 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  45.35 
 
 
287 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.19 
 
 
251 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  28.62 
 
 
252 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  36.17 
 
 
252 aa  125  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  36.17 
 
 
252 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  28.22 
 
 
249 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  55.64 
 
 
136 aa  122  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.85 
 
 
252 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  30.83 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  34.91 
 
 
244 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  28.12 
 
 
249 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  29.72 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  43.4 
 
 
158 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  50 
 
 
139 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  34.72 
 
 
251 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  34.72 
 
 
251 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  52.03 
 
 
145 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4730  IS298, transposase OrfA  49.21 
 
 
129 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 
250 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 
250 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  53.57 
 
 
158 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  29.62 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  31.49 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  42.52 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  50.86 
 
 
121 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  50.86 
 
 
121 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  50.86 
 
 
121 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  40.48 
 
 
157 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0187  hypothetical protein  31.47 
 
 
255 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0325  hypothetical protein  31.47 
 
 
255 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0244  hypothetical protein  31.47 
 
 
255 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2685  transposase, IS4  46.56 
 
 
131 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  31.14 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  41.73 
 
 
125 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  27.62 
 
 
249 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  31.14 
 
 
266 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  23.96 
 
 
249 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  46.96 
 
 
143 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  24.31 
 
 
249 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0497  transposase  46.77 
 
 
131 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0286  transposase  46.77 
 
 
131 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  28.47 
 
 
251 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5459  transposase IS4 family protein  41.42 
 
 
365 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00365854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>