More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0252 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  100 
 
 
139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  58.91 
 
 
125 aa  161  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  58.14 
 
 
125 aa  157  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  55.36 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4730  IS298, transposase OrfA  51.33 
 
 
129 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  49.59 
 
 
121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3276  transposase  53.21 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  49.59 
 
 
121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  49.59 
 
 
121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  50 
 
 
304 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2661  hypothetical protein  68 
 
 
170 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0335597  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3086  putative transposase  51.72 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  51.33 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  51.33 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  51.33 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  51.33 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  51.33 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  46.36 
 
 
135 aa  110  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  46.36 
 
 
135 aa  110  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.67 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  45.45 
 
 
135 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  45.87 
 
 
129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  45.87 
 
 
129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  45.87 
 
 
129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  45.87 
 
 
129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  45.08 
 
 
122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  45.87 
 
 
129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  45.08 
 
 
122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  45.87 
 
 
129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  54.63 
 
 
254 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  54.63 
 
 
254 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  54.63 
 
 
254 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  54.63 
 
 
254 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  54.63 
 
 
254 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  45.9 
 
 
122 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  50.89 
 
 
142 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  51.79 
 
 
142 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  51.79 
 
 
142 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  51.79 
 
 
252 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  50 
 
 
123 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  50 
 
 
123 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  50 
 
 
123 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  43.59 
 
 
126 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0286  transposase  47.27 
 
 
131 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0497  transposase  47.27 
 
 
131 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373343  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  44.14 
 
 
138 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  44.14 
 
 
138 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  45.19 
 
 
132 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  45.19 
 
 
132 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  40.58 
 
 
303 aa  101  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  40.58 
 
 
303 aa  101  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  40.58 
 
 
303 aa  101  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  52.78 
 
 
254 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  52.78 
 
 
254 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  52.78 
 
 
254 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  52.78 
 
 
254 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  45.05 
 
 
138 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  52.78 
 
 
254 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  52.78 
 
 
254 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.75 
 
 
181 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.75 
 
 
181 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.75 
 
 
181 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.75 
 
 
181 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.75 
 
 
181 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  41.88 
 
 
135 aa  100  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  45.22 
 
 
149 aa  100  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  50.45 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  50.45 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  50.45 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  50.45 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  50.45 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  50.45 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  50.45 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  50.45 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  50.45 
 
 
121 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  50.45 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  50.45 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  50.45 
 
 
121 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  50.45 
 
 
121 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  49.57 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  49.57 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  45.05 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  46.34 
 
 
260 aa  96.7  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20970  transposase  46.36 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13900  transposase  46.36 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  43.36 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  43.36 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  43.36 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  43.36 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  43.36 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  43.36 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  45.95 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  45.95 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  45.95 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  45.95 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  45.95 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  45.95 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  45.95 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  45.95 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  45.95 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>