More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6488 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6488  transposase  100 
 
 		 103 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  88.04 
 
 		 123 aa  177  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  88.04 
 
 		 123 aa  177  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  88.04 
 
 		 123 aa  177  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  77.17 
 
 		 254 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  77.17 
 
 		 254 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  77.17 
 
 		 254 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  77.17 
 
 		 254 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  77.17 
 
 		 254 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  77.17 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  78.26 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  78.26 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  75 
 
 		 254 aa  153  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  75 
 
 		 254 aa  153  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  75 
 
 		 254 aa  153  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  75 
 
 		 254 aa  153  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  75 
 
 		 254 aa  153  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  75 
 
 		 254 aa  153  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  76.09 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  76.09 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  71.74 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  71.74 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  75 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  75 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  75 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  75 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  75 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  75 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  75 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  73.86 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  73.86 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  73.86 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  73.86 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  73.86 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  72.73 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  62.5 
 
 		 252 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2821  ISBm1, transposase orfA  71.43 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  56.1 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  56.1 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  56.1 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  56.1 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  56.1 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  69.23 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  69.23 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  69.23 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  47.52 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1962  hypothetical protein  79.59 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  48.24 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  51.16 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  51.16 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  51.16 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  46.32 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  47.06 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.31 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  54.55 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  54.55 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  54.55 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  54.55 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  54.55 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  44.05 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  47.5 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  44 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  44 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.5 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  46.59 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4670  hypothetical protein  47.37 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  46.59 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  46.59 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  40.45 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  39.36 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  43.53 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  42.5 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  42.5 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  48.78 
 
 		 251 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  48.78 
 
 		 251 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  46.34 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  52.17 
 
 		 294 aa  77.4  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  48.78 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  47.56 
 
 		 260 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  46.25 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  46.25 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  53.45 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  46.05 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  46.05 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  41.25 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  46.05 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  46.05 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  53.45 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  46.05 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  46.05 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  46.05 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  47.3 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  38.3 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  38.3 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  38.3 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  38.3 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  38.3 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  38.3 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  38.3 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  44.44 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>