More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1378 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  100 
 
 
157 aa  326  9e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2784  putative transposase  99.13 
 
 
115 aa  240  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0359973  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2701  putative transposase  100 
 
 
93 aa  195  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2626  putative transposase  100 
 
 
93 aa  195  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00808856  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2403  transposase  66.95 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2835  hypothetical protein  75.56 
 
 
92 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  43.8 
 
 
253 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  43.8 
 
 
253 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  43.8 
 
 
253 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  43.8 
 
 
253 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  47.22 
 
 
122 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  47.22 
 
 
122 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  47.22 
 
 
115 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  47.62 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  49.53 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  41.32 
 
 
255 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  47.22 
 
 
122 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  47.22 
 
 
122 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  46.67 
 
 
125 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  47.62 
 
 
117 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  46.3 
 
 
111 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  47.17 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  47.17 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  47.17 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  47.17 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  47.17 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  47.17 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  42.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  42.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  42.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  42.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  42.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  42.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  42.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  42.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  42.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  42.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  42.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  42.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  45.28 
 
 
110 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  43.12 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  42.34 
 
 
124 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  43.12 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  43.81 
 
 
122 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  44.55 
 
 
251 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  40.52 
 
 
253 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  37.31 
 
 
157 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  40 
 
 
126 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  40 
 
 
133 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  40 
 
 
133 aa  102  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  41.28 
 
 
124 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  41.46 
 
 
159 aa  100  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  40.16 
 
 
260 aa  97.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1808  hypothetical protein  45.05 
 
 
94 aa  97.4  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0214  transposase  45.16 
 
 
106 aa  95.5  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  40 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  41.28 
 
 
123 aa  94.4  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  41.28 
 
 
123 aa  94.4  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  41.28 
 
 
123 aa  94.4  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  41.28 
 
 
123 aa  94.4  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  41.28 
 
 
123 aa  94.4  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.34 
 
 
252 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  39.52 
 
 
249 aa  91.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  39.52 
 
 
249 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  39.37 
 
 
259 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8143  putative transposase  38.83 
 
 
127 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  38.6 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  38.6 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  38.58 
 
 
260 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  42.73 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  42.73 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.17 
 
 
251 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  41.6 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  38.58 
 
 
260 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  40 
 
 
260 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2953  hypothetical protein  45.1 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  40 
 
 
260 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  40 
 
 
260 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  40 
 
 
260 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  39.13 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  39.13 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.02 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  39.13 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  38.58 
 
 
273 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  42.06 
 
 
121 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  42.06 
 
 
121 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4819  transposase (putative)  40.59 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  37.17 
 
 
121 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  40.8 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>