More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4824 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  100 
 
 		 122 aa  248  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  100 
 
 		 122 aa  248  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  93.44 
 
 		 122 aa  234  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  88.03 
 
 		 244 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  70.25 
 
 		 126 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  48.31 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  48.31 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  48.31 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  43.36 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.1 
 
 		 281 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  45.08 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.81 
 
 		 281 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.81 
 
 		 281 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.86 
 
 		 281 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.14 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  41.03 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  41.03 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  41.03 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  41.03 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  41.03 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  43.22 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  40.91 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  39.82 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3086  putative transposase  48.72 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  44.04 
 
 		 254 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  44.04 
 
 		 254 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  44.04 
 
 		 254 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  44.04 
 
 		 254 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  44.04 
 
 		 254 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  43.1 
 
 		 255 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  45.05 
 
 		 260 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  43.48 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  40 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  40 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  40 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  38.94 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  40 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  40.68 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  41.88 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  41.88 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  40.68 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  40.68 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.48 
 
 		 252 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  44.07 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  42.2 
 
 		 254 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  39.17 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  39.17 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  42.2 
 
 		 254 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  42.62 
 
 		 260 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  42.2 
 
 		 254 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  42.2 
 
 		 254 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  42.2 
 
 		 254 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  42.2 
 
 		 254 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  44.14 
 
 		 260 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  44.14 
 
 		 260 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  40.98 
 
 		 260 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  40 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  40.98 
 
 		 260 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  41.46 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  40.98 
 
 		 260 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  37.72 
 
 		 181 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  37.72 
 
 		 181 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  37.72 
 
 		 181 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  37.72 
 
 		 181 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  37.72 
 
 		 181 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  44.55 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  41.18 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  41.53 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  41.53 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  38.66 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  38.66 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  38.66 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  38.66 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  38.66 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  38.66 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  38.66 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  38.66 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  38.66 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  38.66 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  43.56 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  43.56 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  43.56 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  43.56 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  43.56 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  43.56 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  43.56 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  43.24 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  42.86 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  37.82 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  42.86 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  42.86 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  37.82 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  37.82 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  42.98 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  42.98 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  42.98 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  42.86 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  42.86 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>