More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3086 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3086  putative transposase  100 
 
 		 126 aa  250  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  52.03 
 
 		 125 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  51.22 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  52.99 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  55.08 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  55.08 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  55.08 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  50.89 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  50.89 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4730  IS298, transposase OrfA  50.41 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  52.34 
 
 		 254 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  52.34 
 
 		 254 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  52.34 
 
 		 254 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  52.34 
 
 		 254 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  52.34 
 
 		 254 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  48.74 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  48.74 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  48.74 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  48.74 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  48.74 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  45.53 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  45.53 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  45.53 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  45.53 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  45.53 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  45.53 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  48.39 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  48.39 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  48.39 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  48.39 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  48.39 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  48.21 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  45.53 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  52.34 
 
 		 254 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  52.34 
 
 		 254 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  52.34 
 
 		 254 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  52.34 
 
 		 254 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  52.34 
 
 		 254 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  52.34 
 
 		 254 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  47.32 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  47.32 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  45.53 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  47.32 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  45.53 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  47.32 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  51.79 
 
 		 252 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  47.32 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  48.21 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  48.21 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  50 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  44.62 
 
 		 304 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  48.18 
 
 		 138 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  48.72 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  48.72 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  46.02 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  46.72 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  45.13 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  45.13 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  45.13 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  45.13 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  45.13 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  45.13 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  45.13 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  45.13 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  45.13 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  45.13 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  45.13 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  45.13 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0286  transposase  48.18 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0497  transposase  48.18 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  43.9 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  42.52 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.07 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  46.53 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  46.53 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  46.53 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  48.7 
 
 		 259 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3439  IS1647-like transposase  44.55 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3276  transposase  56.88 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20970  transposase  48.18 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13900  transposase  48.18 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  44.92 
 
 		 260 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  42.61 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  41.6 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  44.07 
 
 		 260 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  44.07 
 
 		 260 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  44.07 
 
 		 260 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4670  hypothetical protein  47.06 
 
 		 176 aa  93.6  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  41.04 
 
 		 244 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  51.28 
 
 		 294 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  42.61 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  42.61 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  42.61 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  42.61 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  42.61 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  42.61 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  42.61 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  42.61 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>