More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3439 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3439  IS1647-like transposase  100 
 
 
162 aa  331  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4462  IS1647-like transposase  83.59 
 
 
128 aa  214  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  52.63 
 
 
138 aa  150  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  51.59 
 
 
181 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  51.59 
 
 
181 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  51.59 
 
 
181 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  51.59 
 
 
181 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  51.59 
 
 
181 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  52.27 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  52.27 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4670  hypothetical protein  54.81 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3086  putative transposase  44.55 
 
 
126 aa  90.9  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  40.19 
 
 
139 aa  84.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  39.45 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  39.45 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  39.45 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  39.45 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  40.19 
 
 
304 aa  82  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  41.9 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  41.9 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  41.9 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  41.9 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  41.9 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  40.35 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  40.35 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  40.35 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  38.02 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  38.02 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  39.25 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  39.25 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  39.25 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  39.25 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  39.25 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  39.25 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  39.25 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  39.25 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  39.81 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  39.25 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.31 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  40.95 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  40.95 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  40.95 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  40.95 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  40.95 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  40.95 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  35.14 
 
 
143 aa  79  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01472  ISSod6, transposase  34.29 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01489  ISSod6, transposase  34.29 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  37.38 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  42.2 
 
 
110 aa  77  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  36.19 
 
 
144 aa  77  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  40.91 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  39.25 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  35.29 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  35.29 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  35.29 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  37.38 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  37.38 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  37.38 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  37.38 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  37.38 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  37.38 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  40.19 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  36.36 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  36.36 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  41.28 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  41.28 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  38.32 
 
 
255 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  39.05 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  33.64 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  33.64 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  40.37 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.28 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  34.58 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  34.58 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  35.51 
 
 
111 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  34.15 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  34.15 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  34.15 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  34.15 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  34.15 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  34.15 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  34.15 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  34.15 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  34.15 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  34.15 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  35.51 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  32.71 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4730  IS298, transposase OrfA  41.51 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  30.22 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  38.32 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  34.96 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  34.96 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  34.96 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  35.45 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  35.45 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.2 
 
 
281 aa  70.9  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8143  putative transposase  34.55 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  35.78 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  35.78 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>