More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3270 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 
181 aa  358  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 
181 aa  358  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 
181 aa  358  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 
181 aa  358  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 
181 aa  358  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  63.08 
 
 
138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  62.31 
 
 
138 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  62.31 
 
 
138 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4670  hypothetical protein  58.46 
 
 
176 aa  148  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3439  IS1647-like transposase  51.59 
 
 
162 aa  147  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4462  IS1647-like transposase  52.17 
 
 
128 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3086  putative transposase  47.86 
 
 
126 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  46.02 
 
 
123 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  46.02 
 
 
123 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  46.02 
 
 
123 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  46.02 
 
 
123 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  46.02 
 
 
123 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  42.75 
 
 
139 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  46.85 
 
 
125 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.65 
 
 
252 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
142 aa  97.1  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  45 
 
 
142 aa  97.1  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  46.15 
 
 
121 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  46.15 
 
 
121 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  46.15 
 
 
121 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  45.95 
 
 
125 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  47.66 
 
 
254 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  49.54 
 
 
123 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  49.54 
 
 
123 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  47.66 
 
 
254 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  47.66 
 
 
254 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  47.66 
 
 
254 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  47.66 
 
 
254 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  49.54 
 
 
123 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  47.66 
 
 
254 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  49.54 
 
 
254 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  49.54 
 
 
254 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  49.54 
 
 
254 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  49.54 
 
 
254 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  49.54 
 
 
254 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  43.64 
 
 
121 aa  94.7  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  43.64 
 
 
121 aa  94.7  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  43.64 
 
 
121 aa  94.7  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  43.64 
 
 
121 aa  94.4  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  43.64 
 
 
121 aa  94.4  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  43.64 
 
 
121 aa  94.4  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  43.64 
 
 
121 aa  94.4  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  43.64 
 
 
121 aa  94.4  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  43.64 
 
 
121 aa  94.4  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  43.64 
 
 
121 aa  94.4  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  44.55 
 
 
121 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  44.55 
 
 
121 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  44.55 
 
 
121 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  49.54 
 
 
142 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  36.18 
 
 
260 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  36.18 
 
 
260 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  36.18 
 
 
260 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  36.18 
 
 
260 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  39.64 
 
 
143 aa  93.2  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  41.13 
 
 
129 aa  92.4  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  41.13 
 
 
129 aa  92.4  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  41.13 
 
 
129 aa  92.4  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  41.13 
 
 
135 aa  92.4  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  41.13 
 
 
129 aa  92.4  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  41.13 
 
 
129 aa  92.4  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.47 
 
 
281 aa  92.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  41.13 
 
 
129 aa  92.4  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  44.95 
 
 
132 aa  91.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  44.95 
 
 
132 aa  91.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  40.32 
 
 
135 aa  91.7  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  42.73 
 
 
304 aa  90.5  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.74 
 
 
158 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.25 
 
 
281 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  42.86 
 
 
142 aa  89.4  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.19 
 
 
281 aa  89  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  39.52 
 
 
135 aa  89.4  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  42.86 
 
 
142 aa  89.4  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.25 
 
 
281 aa  89.4  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  36.84 
 
 
149 aa  88.2  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  43.36 
 
 
115 aa  87.4  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  40.18 
 
 
132 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  40.18 
 
 
132 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  40.18 
 
 
132 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  40.18 
 
 
132 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  40.18 
 
 
132 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  40.18 
 
 
132 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  40.18 
 
 
132 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  40.18 
 
 
132 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  40.18 
 
 
132 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  40.18 
 
 
132 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  40.18 
 
 
132 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  40.18 
 
 
132 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  43.93 
 
 
144 aa  86.3  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  40.18 
 
 
124 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  40.18 
 
 
124 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  40 
 
 
124 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  41.32 
 
 
252 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  50 
 
 
104 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  50 
 
 
104 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  50 
 
 
104 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>