More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2704 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  100 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  100 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  86.96 
 
 		 115 aa  213  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  82.14 
 
 		 122 aa  200  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  82.14 
 
 		 122 aa  200  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  81.31 
 
 		 117 aa  193  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  54.1 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  53.28 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  52.14 
 
 		 253 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  52.14 
 
 		 253 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  52.14 
 
 		 253 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  52.14 
 
 		 253 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  54.62 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  54.72 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  54.72 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  54.72 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  54.72 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  54.72 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  54.72 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  57.41 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  47.93 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  47.93 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  47.93 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  47.93 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  47.93 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  47.93 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  47.93 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  47.93 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  47.93 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  47.93 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  47.93 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  47.93 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  47.93 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  47.93 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  53.54 
 
 		 253 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  50.93 
 
 		 126 aa  121  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  50.93 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  50.93 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  50.47 
 
 		 255 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  44.55 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  46.73 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  47.22 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  45.45 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  45.76 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  50.39 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0214  transposase  48.04 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  43.2 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  47.66 
 
 		 251 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  43.64 
 
 		 157 aa  104  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  42.06 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  38.4 
 
 		 259 aa  97.1  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  48.54 
 
 		 266 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8545  transposase and inactivated derivative  54.93 
 
 		 73 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  36.97 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  36.97 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  36.97 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  42.98 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  42.98 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  36.97 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  36.97 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  42.98 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  44.04 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  44.04 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4819  transposase (putative)  42.86 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  41.12 
 
 		 252 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  41.12 
 
 		 252 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  41.12 
 
 		 252 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  41.12 
 
 		 252 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  41.12 
 
 		 252 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  41.12 
 
 		 252 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  41.12 
 
 		 252 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  41.12 
 
 		 252 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  41.12 
 
 		 252 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  41.96 
 
 		 138 aa  91.3  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  41.96 
 
 		 138 aa  91.3  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2626  putative transposase  44.83 
 
 		 93 aa  90.9  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00808856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2701  putative transposase  44.83 
 
 		 93 aa  90.9  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1808  hypothetical protein  51.11 
 
 		 94 aa  90.5  8e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  40 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  40 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  42.86 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  42.86 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  42.86 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  43.12 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  43.12 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  43.12 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  43.12 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  43.12 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  43.12 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  43.12 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  41.88 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  41.88 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  41.96 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  42.74 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  40.57 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  37.38 
 
 		 253 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  37.38 
 
 		 253 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  37.38 
 
 		 254 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2291  hypothetical protein  41.75 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.2 
 
 		 252 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>