More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2626 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  100 
 
 
157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2626  putative transposase  100 
 
 
93 aa  193  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00808856  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2701  putative transposase  100 
 
 
93 aa  193  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2835  hypothetical protein  75.56 
 
 
92 aa  147  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2784  putative transposase  98.04 
 
 
115 aa  110  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0359973  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  50.57 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  48.24 
 
 
110 aa  94.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  47.13 
 
 
253 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  47.62 
 
 
253 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  47.62 
 
 
253 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  47.62 
 
 
253 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  49.37 
 
 
253 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  47.62 
 
 
125 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  42.39 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  42.39 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  42.39 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  42.39 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  42.39 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  42.39 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  42.39 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  42.39 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  42.39 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  42.39 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  42.39 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  42.39 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  44.83 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  44.83 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  44.83 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  44.83 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  44.83 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  44.83 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  44.83 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  44.83 
 
 
115 aa  91.3  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  46.43 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  44.83 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  43.18 
 
 
124 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  43.18 
 
 
124 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  44.83 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  44.83 
 
 
122 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  45.24 
 
 
117 aa  89.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  41.11 
 
 
124 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  44.83 
 
 
122 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  42.86 
 
 
255 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  45.78 
 
 
251 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  42.53 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  42.53 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  42.53 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8545  transposase and inactivated derivative  52.94 
 
 
73 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  42.86 
 
 
111 aa  84  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2403  transposase  65 
 
 
144 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  40.91 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  43.9 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  40.91 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1808  hypothetical protein  45.71 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.53 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  43.33 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4819  transposase (putative)  42.22 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  47.44 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0214  transposase  45.83 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  43.21 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  43.21 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  43.21 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  43.21 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  43.21 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  39.53 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  39.53 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  39.53 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  41.46 
 
 
260 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2953  hypothetical protein  43.68 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  41.46 
 
 
260 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.12 
 
 
252 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  42.17 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  42.17 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4670  hypothetical protein  44.58 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0564  hypothetical protein  51.39 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  41.46 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  46.15 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  43.37 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  41.46 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1322  Transposase and inactivated derivatives-like protein  51.67 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  38.1 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  42.86 
 
 
260 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  42.86 
 
 
260 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  42.86 
 
 
260 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  42.86 
 
 
260 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  39.08 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1870  hypothetical protein  44.71 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  41.86 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  41.86 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  41.77 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  41.86 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  41.86 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  41.86 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  41.86 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  41.86 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  41.86 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  41.86 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  41.86 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  41.86 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  41.86 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>