178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2403 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2403  transposase  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  66.95 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2784  putative transposase  65.49 
 
 		 115 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0359973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2626  putative transposase  65 
 
 		 93 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00808856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2701  putative transposase  65 
 
 		 93 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2835  hypothetical protein  58.57 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  41.98 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  42.86 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  42.86 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  42.86 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  39.76 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  39.76 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  38.75 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  34.41 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  34.41 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  34.41 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  34.41 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  35.8 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  35.8 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  38.27 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  38.27 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  38.27 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  38.27 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  38.27 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  38.27 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00502  transposase  40 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  32.91 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01489  ISSod6, transposase  36.67 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01472  ISSod6, transposase  36.67 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02496  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  36.56 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  34.18 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  40 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  40 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  40 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  40 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  34.57 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  34.57 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  34.57 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  34.57 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  34.57 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  34.57 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  35.62 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  34.57 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  34.57 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  34.48 
 
 		 252 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  34.65 
 
 		 235 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  39.58 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  34.86 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8143  putative transposase  30.77 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  33.33 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  30.93 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  30.93 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  30.93 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  34.91 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  31.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  31.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0214  transposase  31.65 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  31.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  31.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  31.65 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  31.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  31.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  31.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  31.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  31.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  31.65 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  31.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  31.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  31.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  32.88 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  32.18 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  31.17 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  30.11 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  33.33 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  31.11 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2953  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  31.82 
 
 		 260 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  31.82 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  31.82 
 
 		 260 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  32.47 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  31.82 
 
 		 260 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  32.47 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1808  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 		 250 aa  52  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 		 250 aa  52  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  30.77 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  29.89 
 
 		 249 aa  50.8  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  31.25 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  31.25 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  31.25 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  31.25 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  31.25 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  31.25 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  31.25 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  31.25 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>