More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01489 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01472  ISSod6, transposase  100 
 
 
173 aa  356  7e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01489  ISSod6, transposase  100 
 
 
173 aa  356  7e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  66.87 
 
 
252 aa  236  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  68.71 
 
 
252 aa  233  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  68.71 
 
 
252 aa  233  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  68.71 
 
 
252 aa  233  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  68.71 
 
 
252 aa  233  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  68.71 
 
 
252 aa  233  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  68.71 
 
 
252 aa  233  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  68.71 
 
 
252 aa  233  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  68.71 
 
 
252 aa  233  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  68.1 
 
 
252 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  66.87 
 
 
253 aa  231  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  66.87 
 
 
253 aa  231  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  66.26 
 
 
249 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  66.26 
 
 
249 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  66.26 
 
 
253 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  66.26 
 
 
249 aa  228  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  71.33 
 
 
254 aa  227  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02496  hypothetical protein  70.13 
 
 
156 aa  227  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  65.03 
 
 
249 aa  225  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  54.88 
 
 
245 aa  180  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00502  transposase  71.15 
 
 
112 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  44.31 
 
 
253 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  44.31 
 
 
253 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  44.31 
 
 
253 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  44.31 
 
 
253 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 
250 aa  141  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 
250 aa  141  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  46.34 
 
 
249 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  43.37 
 
 
255 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  40.72 
 
 
253 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.37 
 
 
251 aa  121  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.76 
 
 
281 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  36.16 
 
 
266 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  37.24 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  42.47 
 
 
249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  39.61 
 
 
259 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  41.78 
 
 
249 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.43 
 
 
281 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  37.2 
 
 
254 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  37.2 
 
 
254 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  37.2 
 
 
254 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  37.2 
 
 
254 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  37.2 
 
 
254 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  37.58 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  37.58 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.84 
 
 
281 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.84 
 
 
281 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  37.2 
 
 
254 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  37.2 
 
 
254 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  37.2 
 
 
254 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  37.2 
 
 
254 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  37.2 
 
 
254 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  37.2 
 
 
254 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  36.26 
 
 
260 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2291  hypothetical protein  50.49 
 
 
155 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  36.26 
 
 
260 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  36.26 
 
 
260 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  36.26 
 
 
260 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  38.89 
 
 
244 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  36.47 
 
 
260 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.55 
 
 
252 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.55 
 
 
252 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  35.12 
 
 
303 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  35.12 
 
 
303 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  35.12 
 
 
303 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  36.69 
 
 
260 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  36.69 
 
 
260 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  32.89 
 
 
336 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2056  hypothetical protein  54.35 
 
 
124 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  35.23 
 
 
273 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  32.26 
 
 
252 aa  99  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  32.26 
 
 
252 aa  99  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  33.94 
 
 
251 aa  98.6  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  44.86 
 
 
111 aa  97.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2953  hypothetical protein  43.9 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  31.66 
 
 
304 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  34.73 
 
 
294 aa  96.3  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  44.34 
 
 
122 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  36.76 
 
 
235 aa  92  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  39.81 
 
 
125 aa  89  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.3 
 
 
252 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  40.52 
 
 
123 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  40.52 
 
 
123 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  40.52 
 
 
123 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  39.81 
 
 
125 aa  88.2  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  40.52 
 
 
123 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  40.52 
 
 
123 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  37.14 
 
 
124 aa  87.8  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0794  hypothetical protein  62.71 
 
 
96 aa  87.8  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.906116  hitchhiker  0.00155993 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  40.19 
 
 
117 aa  85.9  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  40.19 
 
 
117 aa  85.9  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  40.19 
 
 
117 aa  85.9  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  40.19 
 
 
117 aa  85.9  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  40.19 
 
 
117 aa  85.9  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  40.19 
 
 
117 aa  85.9  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  35.54 
 
 
255 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  40.35 
 
 
126 aa  85.1  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  35.54 
 
 
255 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>