More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00502 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00502  transposase  100 
 
 		 112 aa  231  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  93.75 
 
 		 253 aa  222  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  93.75 
 
 		 254 aa  222  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  93.75 
 
 		 253 aa  222  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  93.75 
 
 		 253 aa  222  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  93.52 
 
 		 249 aa  213  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  93.52 
 
 		 249 aa  213  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  93.52 
 
 		 249 aa  213  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02496  hypothetical protein  93.52 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  77.14 
 
 		 252 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  77.14 
 
 		 252 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  77.14 
 
 		 252 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  77.14 
 
 		 252 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  77.14 
 
 		 252 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  77.14 
 
 		 252 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  77.14 
 
 		 252 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  77.14 
 
 		 252 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  77.14 
 
 		 252 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  75.24 
 
 		 252 aa  179  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  78.22 
 
 		 249 aa  179  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01472  ISSod6, transposase  71.15 
 
 		 173 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01489  ISSod6, transposase  71.15 
 
 		 173 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  52.48 
 
 		 245 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  49.55 
 
 		 250 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  49.55 
 
 		 250 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2291  hypothetical protein  50.5 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  49.51 
 
 		 249 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0794  hypothetical protein  73.02 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.906116  hitchhiker  0.00155993 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  43.86 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  40.35 
 
 		 253 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  40.35 
 
 		 253 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  40.35 
 
 		 253 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  40.35 
 
 		 253 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  44.14 
 
 		 255 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  41.82 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  41.12 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  41.82 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  41.82 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  40.19 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  40.19 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  40.95 
 
 		 111 aa  90.5  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  37.27 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  37.27 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  37.27 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  37.27 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  37.27 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  40.91 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  39.25 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  39.25 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  38.89 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  38.89 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  38.89 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  38.89 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  38.89 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  38.89 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.3 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  43.01 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0423  transposase ISSod6  44.34 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.653071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  37.38 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  43.01 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  43.01 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  37.38 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  40.87 
 
 		 135 aa  84.7  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  40 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  40 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  40.87 
 
 		 135 aa  84.7  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  40 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  40.18 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  38.24 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  34.29 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  34.29 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  40 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  40.2 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  34.29 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  40 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  40 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  40 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  40 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  40 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  39.13 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  40 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  34.29 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  34.29 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  34.29 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  34.29 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  34.29 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  34.29 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  34.29 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  35.29 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  35.29 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  37.76 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  37.76 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  37.62 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  37.62 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  37.62 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  37.62 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  37.62 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1808  hypothetical protein  48.75 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  37.76 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>