More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02496 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02496  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  323  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  100 
 
 
253 aa  318  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  318  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  317  5e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  99.35 
 
 
249 aa  316  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  99.35 
 
 
249 aa  316  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  99.35 
 
 
253 aa  316  7e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  98.04 
 
 
249 aa  312  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  77.78 
 
 
252 aa  255  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  77.78 
 
 
252 aa  255  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  77.78 
 
 
252 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  77.78 
 
 
252 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  77.78 
 
 
252 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  77.78 
 
 
252 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  77.78 
 
 
252 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  77.78 
 
 
252 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  77.12 
 
 
249 aa  253  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  77.12 
 
 
252 aa  253  8e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  74.34 
 
 
252 aa  244  4.9999999999999997e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01489  ISSod6, transposase  70.13 
 
 
173 aa  227  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01472  ISSod6, transposase  70.13 
 
 
173 aa  227  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00502  transposase  93.52 
 
 
112 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  50.32 
 
 
245 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  47.71 
 
 
250 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  47.71 
 
 
250 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  43.04 
 
 
253 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  43.04 
 
 
253 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  43.04 
 
 
253 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  43.04 
 
 
253 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  46.71 
 
 
249 aa  135  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  45.57 
 
 
255 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  43.18 
 
 
253 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.46 
 
 
281 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2291  hypothetical protein  49.04 
 
 
155 aa  110  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  41.76 
 
 
303 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  41.76 
 
 
303 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  41.76 
 
 
303 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.14 
 
 
281 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.14 
 
 
281 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  35.71 
 
 
254 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  34.15 
 
 
244 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.57 
 
 
281 aa  104  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  35.71 
 
 
254 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  35.71 
 
 
254 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  35.71 
 
 
254 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  35.71 
 
 
254 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  39.39 
 
 
259 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  34.03 
 
 
157 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  35.71 
 
 
254 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  35.71 
 
 
254 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  35.71 
 
 
254 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  35.71 
 
 
254 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  35.71 
 
 
254 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  35.71 
 
 
254 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  34.78 
 
 
266 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  36.67 
 
 
249 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  36.67 
 
 
249 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0794  hypothetical protein  72.88 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.906116  hitchhiker  0.00155993 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2056  hypothetical protein  54.88 
 
 
124 aa  98.6  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  33.95 
 
 
260 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  33.95 
 
 
260 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  33.95 
 
 
260 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  33.95 
 
 
260 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  39.84 
 
 
235 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  34.19 
 
 
251 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.17 
 
 
252 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  34.97 
 
 
304 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  50.65 
 
 
125 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  40.91 
 
 
122 aa  94  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  40.19 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  40.19 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  40.19 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  39.81 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  33.77 
 
 
260 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.85 
 
 
252 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.34 
 
 
251 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.85 
 
 
252 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  49.35 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  40.95 
 
 
111 aa  90.1  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2953  hypothetical protein  44.9 
 
 
149 aa  90.5  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  34.94 
 
 
255 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  34.94 
 
 
255 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  40.34 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  39.81 
 
 
115 aa  88.2  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  37.5 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  37.5 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  31.82 
 
 
260 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  37.5 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  37.5 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  37.5 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  31.82 
 
 
260 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  31.82 
 
 
273 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  43.48 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  43.48 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  43.48 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  32.52 
 
 
336 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  40.78 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  32.48 
 
 
251 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  32.48 
 
 
251 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  38.83 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>