More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0423 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0423  transposase ISSod6  100 
 
 
142 aa  300  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.653071 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  83.67 
 
 
249 aa  173  9e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  75 
 
 
250 aa  169  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  75 
 
 
250 aa  169  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  37.88 
 
 
245 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2291  hypothetical protein  52.44 
 
 
155 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  39.68 
 
 
253 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  39.68 
 
 
254 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00502  transposase  44.34 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  39.68 
 
 
253 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  39.68 
 
 
253 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  37.3 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  37.3 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  37.3 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  37.3 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  37.3 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  37.3 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  37.3 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  37.3 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  37.3 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  37.7 
 
 
249 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02496  hypothetical protein  37.7 
 
 
156 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  37.7 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  37.7 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01472  ISSod6, transposase  36.89 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01489  ISSod6, transposase  36.89 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  35.25 
 
 
249 aa  73.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  35.59 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  30.89 
 
 
260 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  30.89 
 
 
260 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  30.89 
 
 
260 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  31.15 
 
 
260 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  37.96 
 
 
255 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  38.89 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  38.89 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  38.89 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  31.01 
 
 
253 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  31.01 
 
 
253 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  31.01 
 
 
253 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  31.01 
 
 
253 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0794  hypothetical protein  39.24 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.906116  hitchhiker  0.00155993 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  35.23 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  36 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  32.71 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  36.79 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  36.79 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  36.79 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  36.79 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  36.79 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  36.79 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4670  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  38.89 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  38.89 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  38.24 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  38.24 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  38.24 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  31.78 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  38.24 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  38.24 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  38.24 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  38.24 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  34.44 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2953  hypothetical protein  30.61 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  27.68 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00500  transposase  48.21 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02495  hypothetical protein  48.21 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25510  Transposase, IS4  50 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  30.84 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  30.84 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  30.84 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  30.84 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  30.84 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  37.65 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  30 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  30.28 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  27.64 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  29.2 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  29.2 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  33.33 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  33.33 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  32.69 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.25 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  30.43 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  36.76 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8545  transposase and inactivated derivative  40 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  36.76 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1808  hypothetical protein  37.33 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  29.09 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  33.94 
 
 
259 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  28.68 
 
 
253 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  32.74 
 
 
251 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  35.06 
 
 
273 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  35.11 
 
 
303 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  35.11 
 
 
303 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4730  IS298, transposase OrfA  31.71 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  34.92 
 
 
303 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  35.14 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  35.14 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  35.14 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>