More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2784 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2784  putative transposase  100 
 
 
115 aa  241  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0359973  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  99.13 
 
 
157 aa  240  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2403  transposase  65.49 
 
 
144 aa  152  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2626  putative transposase  98.04 
 
 
93 aa  110  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00808856  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2701  putative transposase  98.04 
 
 
93 aa  110  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  46.59 
 
 
253 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  46.59 
 
 
253 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  46.59 
 
 
253 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  46.59 
 
 
253 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2835  hypothetical protein  82 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  51.39 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  51.39 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  40.91 
 
 
255 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  48 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  48.61 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  48.61 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  47.22 
 
 
115 aa  84  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  48.61 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  48.61 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  48.61 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  40.91 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  47.89 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  47.14 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  47.14 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  47.14 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  47.14 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  47.14 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  47.14 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  45.05 
 
 
259 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  43.48 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  37.93 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  36.78 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01489  ISSod6, transposase  39.08 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  42.86 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  37.89 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01472  ISSod6, transposase  39.08 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  37.93 
 
 
252 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  37.93 
 
 
252 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  37.93 
 
 
252 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  37.93 
 
 
252 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  37.93 
 
 
252 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  37.93 
 
 
252 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  37.93 
 
 
252 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  37.93 
 
 
252 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  41.58 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  37.93 
 
 
252 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02496  hypothetical protein  34.48 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  34.48 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  34.48 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  34.48 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  34.48 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  34.48 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  41.57 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  34.48 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  45.07 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  41.57 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  41.57 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  41.57 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  37.93 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  40.58 
 
 
251 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  36.9 
 
 
249 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  43.66 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  43.66 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  45.07 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  43.66 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  43.66 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  43.66 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  43.66 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  43.66 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  43.66 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  43.66 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  43.66 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  43.66 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  43.66 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00502  transposase  40.58 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0214  transposase  43.66 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  43.66 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  43.66 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  42.53 
 
 
249 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  41.67 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8143  putative transposase  40 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  43.06 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  43.06 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  43.06 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  43.06 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  43.06 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  35.44 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  35.44 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2291  hypothetical protein  37.78 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  35.44 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  41.38 
 
 
249 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  40.28 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  40.28 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  40.28 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  39.56 
 
 
260 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  40.26 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  40.26 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  44.44 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  44.44 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>