More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1754 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1754  transposase  100 
 
 		 159 aa  336  7e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4819  transposase (putative)  82 
 
 		 109 aa  184  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  80.39 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4250  putative transposase  80.3 
 
 		 66 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  45.08 
 
 		 255 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  50.47 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  39.84 
 
 		 253 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  39.84 
 
 		 253 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  39.84 
 
 		 253 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  39.84 
 
 		 253 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  42.98 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  42.98 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  42.98 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  42.98 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  42.98 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  42.98 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  41.46 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  46.73 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  41.82 
 
 		 122 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  41.46 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  41.46 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  41.46 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  41.46 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  41.46 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  41.46 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  41.46 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  41.46 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  41.46 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  41.46 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  41.46 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  41.46 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  45.05 
 
 		 139 aa  97.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  42.06 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  42.06 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8143  putative transposase  42.11 
 
 		 127 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  42.72 
 
 		 111 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  42.99 
 
 		 122 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  42.99 
 
 		 122 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  42.24 
 
 		 124 aa  95.5  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  42.24 
 
 		 124 aa  95.5  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  42.86 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  42.86 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  41.13 
 
 		 133 aa  95.5  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  40.74 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  39.5 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  43.69 
 
 		 117 aa  94  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  40.74 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  40.52 
 
 		 122 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  36.8 
 
 		 260 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  43.8 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  43.8 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  43.8 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2953  hypothetical protein  39.5 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  40.48 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  41.12 
 
 		 115 aa  91.3  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.14 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  36.36 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  34.96 
 
 		 253 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  40 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  40 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  40.52 
 
 		 124 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  35.77 
 
 		 126 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  36.59 
 
 		 260 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  36.59 
 
 		 260 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  40.18 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  38.17 
 
 		 244 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  40.95 
 
 		 254 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  40.95 
 
 		 254 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  40.95 
 
 		 254 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  42.86 
 
 		 266 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  40.95 
 
 		 254 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  40.95 
 
 		 254 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  36.59 
 
 		 273 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  39.25 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  37.86 
 
 		 251 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  36.8 
 
 		 259 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  43.75 
 
 		 125 aa  85.1  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  40.37 
 
 		 142 aa  84.7  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  40.35 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  40.35 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.59 
 
 		 181 aa  84  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.59 
 
 		 181 aa  84  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  40.35 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  40.35 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  40.35 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.59 
 
 		 181 aa  84  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.59 
 
 		 181 aa  84  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  42.59 
 
 		 181 aa  84  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  40.35 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  40.35 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  38.32 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  38.32 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  35.71 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  40.35 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  40.35 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  36.7 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  36.7 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  36.7 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  39.81 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>