More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1322 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1322  Transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 
285 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0316  hypothetical protein  63.64 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2626  putative transposase  51.67 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00808856  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2701  putative transposase  51.67 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2835  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2337  hypothetical protein  38.1 
 
 
1035 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  36.97 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.31 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  33.65 
 
 
123 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  33.65 
 
 
123 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  33.65 
 
 
123 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  33.65 
 
 
123 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  33.65 
 
 
123 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  43.75 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  45.9 
 
 
122 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  36.19 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  45.9 
 
 
122 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1870  hypothetical protein  44.83 
 
 
90 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.75 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  41.94 
 
 
126 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  40.62 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0564  hypothetical protein  44.44 
 
 
90 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.75 
 
 
281 aa  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  50.82 
 
 
157 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  45.16 
 
 
122 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  40.62 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  40.62 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  40.62 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  44.07 
 
 
121 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.19 
 
 
281 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  49.21 
 
 
110 aa  62.4  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  42.86 
 
 
294 aa  62  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4670  hypothetical protein  46.03 
 
 
176 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  43.33 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  50 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  43.55 
 
 
159 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  49.21 
 
 
129 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  49.21 
 
 
129 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2661  hypothetical protein  45.31 
 
 
170 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0335597  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  49.21 
 
 
129 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  49.21 
 
 
129 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  49.21 
 
 
129 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  49.21 
 
 
129 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.62 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  42.37 
 
 
121 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  42.37 
 
 
121 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  49.21 
 
 
135 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  42.37 
 
 
121 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  42.37 
 
 
121 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  42.37 
 
 
121 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  42.37 
 
 
121 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  42.37 
 
 
121 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  42.37 
 
 
121 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  42.37 
 
 
121 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  42.37 
 
 
121 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  42.37 
 
 
121 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  42.37 
 
 
121 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  46.03 
 
 
122 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  46.03 
 
 
122 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  37.84 
 
 
181 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  37.84 
 
 
181 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  37.84 
 
 
181 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  37.84 
 
 
181 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  37.84 
 
 
181 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  46.77 
 
 
122 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  46.77 
 
 
122 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0129  ISSod6 transposase  40.35 
 
 
92 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  47.62 
 
 
135 aa  59.7  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  47.62 
 
 
135 aa  59.7  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  39.68 
 
 
143 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  32.35 
 
 
132 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  39.68 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  32.35 
 
 
132 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  41.27 
 
 
125 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  41.27 
 
 
125 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  44.07 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  46.55 
 
 
117 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  46.03 
 
 
158 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  43.55 
 
 
115 aa  57.4  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  43.33 
 
 
117 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  43.33 
 
 
117 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  40.32 
 
 
123 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  43.33 
 
 
117 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  40.32 
 
 
123 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  40.32 
 
 
123 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  43.33 
 
 
117 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  43.33 
 
 
117 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  43.33 
 
 
117 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  41.54 
 
 
121 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  41.54 
 
 
121 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  41.54 
 
 
121 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  43.94 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  35.14 
 
 
139 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8545  transposase and inactivated derivative  39.68 
 
 
73 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  43.94 
 
 
260 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  43.94 
 
 
260 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4250  putative transposase  38.71 
 
 
66 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750496  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  45.31 
 
 
122 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  44.62 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  44.62 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>