More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9099 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  100 
 
 
189 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  57.3 
 
 
192 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  53.93 
 
 
203 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  52.81 
 
 
191 aa  187  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  49.45 
 
 
204 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  50.56 
 
 
199 aa  181  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  50.56 
 
 
199 aa  181  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  45.11 
 
 
206 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  48.9 
 
 
193 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  47.75 
 
 
199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  48.62 
 
 
196 aa  161  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  46.63 
 
 
191 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  45.36 
 
 
195 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  46.07 
 
 
196 aa  158  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  47.19 
 
 
191 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  43.58 
 
 
204 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  47.19 
 
 
191 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  41.71 
 
 
197 aa  155  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  44.69 
 
 
197 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  46.63 
 
 
191 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  44.75 
 
 
202 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  44.07 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  43.02 
 
 
204 aa  151  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  40.45 
 
 
203 aa  148  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  50.31 
 
 
204 aa  147  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  49.07 
 
 
203 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  45.86 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  41.67 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  47.8 
 
 
208 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  40 
 
 
186 aa  142  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  42.39 
 
 
190 aa  140  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  42.11 
 
 
194 aa  140  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  45.76 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  42.7 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  36.56 
 
 
212 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  43.18 
 
 
211 aa  135  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  37.08 
 
 
193 aa  127  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  38.42 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  36.67 
 
 
205 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  39.55 
 
 
338 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.02 
 
 
353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  39.33 
 
 
344 aa  118  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  36.46 
 
 
345 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0394  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.04 
 
 
352 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000553759  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  37.57 
 
 
334 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  36.72 
 
 
337 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  38.89 
 
 
329 aa  110  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.49 
 
 
365 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.56 
 
 
355 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.57 
 
 
419 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.64 
 
 
394 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.44 
 
 
371 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3867  chemotaxis-specific methylesterase  34.27 
 
 
368 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  37.3 
 
 
387 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02866  chemotaxis-specific methylesterase  32.09 
 
 
369 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  37.78 
 
 
350 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4337  chemotaxis-specific methylesterase  32.58 
 
 
370 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079226  normal  0.165639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3433  chemotaxis-specific methylesterase  32.02 
 
 
386 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.891132  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3906  chemotaxis-specific methylesterase  32.58 
 
 
376 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0528472  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  36.46 
 
 
364 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1530  chemotaxis-specific methylesterase  32.58 
 
 
370 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3663  chemotaxis-specific methylesterase  32.58 
 
 
374 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  36.36 
 
 
339 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  34.94 
 
 
340 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.72 
 
 
385 aa  106  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1983  protein-glutamate methylesterase CheB  30.77 
 
 
390 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333749  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  36.52 
 
 
351 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  33.73 
 
 
344 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  33.73 
 
 
344 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.57 
 
 
379 aa  105  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2801  chemotaxis-specific methylesterase  31.49 
 
 
375 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45580  chemotaxis-specific methylesterase  32.58 
 
 
368 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  0.505657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2635  CheB methylesterase  34.08 
 
 
262 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.177706  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1650  chemotaxis-specific methylesterase  32.4 
 
 
377 aa  104  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002836  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase CheB  32.4 
 
 
370 aa  104  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.51 
 
 
356 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.92 
 
 
371 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.46 
 
 
364 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.36 
 
 
350 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  35.91 
 
 
347 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  34.73 
 
 
345 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2281  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.89 
 
 
361 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36.07 
 
 
1399 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  37.11 
 
 
351 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  34.05 
 
 
385 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  36.26 
 
 
354 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3206  CheB methylesterase  35.83 
 
 
258 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1567  chemotaxis-specific methylesterase  30.77 
 
 
378 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.02 
 
 
363 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2310  CheB methylesterase  34.76 
 
 
216 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2286  chemotaxis-specific methylesterase  30.32 
 
 
380 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2821  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.08 
 
 
364 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.148608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0952  CheB methylesterase  32.22 
 
 
183 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.421846  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  35.48 
 
 
362 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6398  CheB methylesterase  38.75 
 
 
330 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6210  CheB methylesterase  38.75 
 
 
342 aa  101  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0111856  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03140  chemotaxis-specific methylesterase  31.84 
 
 
371 aa  101  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.8 
 
 
365 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3304  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.72 
 
 
344 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.836526  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  32.52 
 
 
1200 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>